More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_78259 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_78259  predicted protein  100 
 
 
437 aa  892    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.120102  normal  0.0812781 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05166  phosphatidate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G07010)  46.88 
 
 
450 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422511  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND00990  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  41.71 
 
 
646 aa  349  6e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.736712  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32481  predicted protein  35.16 
 
 
478 aa  218  2e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0640896  decreased coverage  0.0098144 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_7678  predicted protein  37.79 
 
 
134 aa  97.8  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  32.61 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  29.34 
 
 
296 aa  77  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  27.93 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  29.59 
 
 
281 aa  73.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  30.9 
 
 
342 aa  72.4  0.00000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  30.36 
 
 
270 aa  71.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  26.56 
 
 
285 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  29.76 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  34.1 
 
 
306 aa  69.3  0.0000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  26.95 
 
 
285 aa  69.7  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  30.41 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  28.39 
 
 
254 aa  67.8  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.09 
 
 
278 aa  66.6  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  25.32 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  27.54 
 
 
285 aa  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0593  phosphatidate cytidylyltransferase  30.49 
 
 
381 aa  66.2  0.000000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  28.66 
 
 
267 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  28.66 
 
 
264 aa  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  31.07 
 
 
294 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  29.07 
 
 
295 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  26.89 
 
 
252 aa  65.1  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  24.14 
 
 
264 aa  63.5  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  23.56 
 
 
310 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  25 
 
 
262 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  26.02 
 
 
264 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  27.84 
 
 
261 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  28.63 
 
 
260 aa  62.4  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  29.11 
 
 
264 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1783  phosphatidate cytidylyltransferase  26.86 
 
 
274 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  28.32 
 
 
280 aa  61.2  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0051  phosphatidate cytidylyltransferase  29.31 
 
 
306 aa  61.6  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000904282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  27.22 
 
 
258 aa  61.6  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  28.24 
 
 
284 aa  61.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  25.9 
 
 
302 aa  60.8  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  30.82 
 
 
275 aa  60.8  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  28.4 
 
 
280 aa  61.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  34.44 
 
 
290 aa  60.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  26.42 
 
 
296 aa  60.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  25.09 
 
 
297 aa  60.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  31.45 
 
 
275 aa  60.5  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  26.16 
 
 
246 aa  60.5  0.00000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  26.97 
 
 
286 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  25.26 
 
 
279 aa  59.3  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  25.95 
 
 
233 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  27.27 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  31.36 
 
 
328 aa  58.9  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  26.67 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1262  phosphatidate cytidylyltransferase  29.19 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.712909  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  29.89 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5324  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0966585  normal  0.436888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  30.26 
 
 
251 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  26.47 
 
 
275 aa  58.5  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  26.97 
 
 
286 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2034  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
273 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  28.74 
 
 
263 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2286  phosphatidate cytidylyltransferase  26.67 
 
 
295 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318424 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  29.17 
 
 
242 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1280  phosphatidate cytidylyltransferase  28.4 
 
 
270 aa  58.2  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  28.48 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  23.64 
 
 
475 aa  58.2  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0710  phosphatidate cytidylyltransferase  28.24 
 
 
341 aa  57.8  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0296449  hitchhiker  0.000000614335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2047  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
273 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  28.48 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0122  phosphatidate cytidylyltransferase  25.75 
 
 
253 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.725689  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  25.68 
 
 
241 aa  58.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  28.48 
 
 
309 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  27.01 
 
 
293 aa  57.8  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1916  phosphatidate cytidylyltransferase  30.27 
 
 
273 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6063  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
273 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  30.99 
 
 
259 aa  57.8  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  31.37 
 
 
273 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  25.14 
 
 
241 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  29.17 
 
 
282 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  27.22 
 
 
309 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  29.17 
 
 
282 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  27.19 
 
 
260 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  30.18 
 
 
282 aa  57.4  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  29.17 
 
 
282 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  28.32 
 
 
282 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  27.19 
 
 
260 aa  57.4  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  29.11 
 
 
318 aa  57  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  27.07 
 
 
285 aa  57  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  27.38 
 
 
270 aa  57.4  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  23.1 
 
 
286 aa  57  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  29.11 
 
 
310 aa  56.6  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  30.86 
 
 
261 aa  56.6  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0363  phosphatidate cytidylyltransferase  28.65 
 
 
241 aa  56.6  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  27.98 
 
 
284 aa  56.6  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  26.24 
 
 
283 aa  56.6  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  25.91 
 
 
260 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  28.07 
 
 
285 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  28.24 
 
 
301 aa  56.2  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  28.3 
 
 
296 aa  56.2  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2974  phosphatidate cytidylyltransferase  29.65 
 
 
285 aa  56.2  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  22.32 
 
 
317 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>