More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_55037 on replicon NC_011690
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011690  PHATRDRAFT_55037  sensor kinase protein 3  100 
 
 
1017 aa  2110    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.988682  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.37 
 
 
1625 aa  181  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.3 
 
 
1611 aa  179  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.03 
 
 
1578 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 
1266 aa  169  2e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.21 
 
 
1203 aa  167  6.9999999999999995e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.68 
 
 
1363 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.26 
 
 
1313 aa  165  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 
1629 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_47689  sensor kinase protein 4  26.04 
 
 
838 aa  164  9e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.31 
 
 
877 aa  162  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.02 
 
 
1369 aa  162  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.26 
 
 
882 aa  161  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.34 
 
 
1659 aa  160  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.82 
 
 
1426 aa  160  9e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  23.06 
 
 
1626 aa  159  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 
1002 aa  159  3e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.34 
 
 
763 aa  159  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.77 
 
 
1629 aa  159  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 
1297 aa  155  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.05 
 
 
1291 aa  155  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.76 
 
 
1632 aa  154  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.26 
 
 
1177 aa  154  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5316  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.85 
 
 
1069 aa  154  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.72275  normal  0.481403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6270  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
952 aa  154  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.988146  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  24.08 
 
 
1364 aa  153  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.87 
 
 
869 aa  152  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.71 
 
 
1501 aa  152  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
674 aa  151  6e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.46 
 
 
911 aa  150  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.69 
 
 
1611 aa  150  9e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  23.86 
 
 
1179 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.7 
 
 
1374 aa  149  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  25.93 
 
 
772 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.12 
 
 
1070 aa  147  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  24.09 
 
 
1019 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.28 
 
 
637 aa  145  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  23.1 
 
 
1418 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
593 aa  145  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0993289 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.66 
 
 
1120 aa  145  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  22.09 
 
 
935 aa  145  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  23.19 
 
 
1765 aa  144  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2769  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 
773 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.87 
 
 
1118 aa  144  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 
1222 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  23.28 
 
 
1417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
902 aa  142  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2940  PAS  22.16 
 
 
1353 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  23.79 
 
 
1061 aa  142  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.65 
 
 
1223 aa  142  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.75 
 
 
903 aa  141  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.7 
 
 
1158 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  23.44 
 
 
1062 aa  140  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2304  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 
870 aa  140  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 
1202 aa  140  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3532  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.76 
 
 
1271 aa  140  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0692  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
620 aa  139  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5254  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.55 
 
 
579 aa  139  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601488  normal  0.0228125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.6 
 
 
989 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.73 
 
 
780 aa  138  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.29 
 
 
1193 aa  138  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.5 
 
 
869 aa  138  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.59 
 
 
1771 aa  138  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.77 
 
 
896 aa  137  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.61 
 
 
1229 aa  137  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.09 
 
 
969 aa  137  9e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2831  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.58 
 
 
1407 aa  137  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.160519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1017  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 
1323 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0385374  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  22.99 
 
 
1028 aa  136  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.8 
 
 
1287 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.47 
 
 
901 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.135172  normal  0.385882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 
959 aa  135  3.9999999999999996e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 
926 aa  135  3.9999999999999996e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.87 
 
 
1622 aa  135  5e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 
765 aa  135  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.33 
 
 
1172 aa  134  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  34.85 
 
 
667 aa  134  7.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  25.97 
 
 
1236 aa  134  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0973  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 
1064 aa  134  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3548  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.81 
 
 
1007 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.508984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2094  virulence sensor protein BvgS  31.37 
 
 
691 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.42 
 
 
1116 aa  133  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6547  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 
865 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.325935 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1712  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.01 
 
 
1173 aa  132  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0980923  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.78 
 
 
1348 aa  132  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  25.52 
 
 
1026 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 
1234 aa  132  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.3 
 
 
1053 aa  132  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 
627 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
767 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.91 
 
 
1309 aa  132  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0473  ATP-binding region ATPase domain protein  29.72 
 
 
719 aa  131  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5292  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
524 aa  131  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 
1058 aa  132  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0171  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
868 aa  131  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.766824  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 
1043 aa  131  7.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2699  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 
1099 aa  131  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117538 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.86 
 
 
781 aa  131  8.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.16 
 
 
939 aa  131  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
737 aa  130  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>