More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3693 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3693  histidine kinase  100 
 
 
667 aa  1379    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  42.43 
 
 
544 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
927 aa  306  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0261  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
948 aa  276  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.52 
 
 
1101 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 
1260 aa  258  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2648  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
997 aa  253  7e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 
1064 aa  247  4.9999999999999997e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
770 aa  246  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 
745 aa  242  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  29.12 
 
 
925 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0585  ATP-binding region ATPase domain protein  34.71 
 
 
528 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.215545  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
916 aa  240  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  29.26 
 
 
925 aa  239  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2282  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.23 
 
 
685 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
1691 aa  238  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0129  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 
752 aa  237  4e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1691  sensor histidine kinase/response regulator GacS  30.35 
 
 
917 aa  236  9e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  31.17 
 
 
1322 aa  236  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
929 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  30.07 
 
 
905 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3698  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.16 
 
 
917 aa  233  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.34744  hitchhiker  0.00600076 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0298  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
899 aa  233  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0542846  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 
784 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3680  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.55 
 
 
744 aa  232  2e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.614037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.6 
 
 
923 aa  230  7e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  30.44 
 
 
1177 aa  229  1e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
936 aa  228  2e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0315  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
757 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
636 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
1202 aa  228  4e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 
758 aa  226  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1363 aa  226  1e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1767 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1767 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1654  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 
837 aa  226  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00856937  normal  0.28263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2229  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.09 
 
 
1049 aa  225  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664054  normal  0.108682 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  30.64 
 
 
1214 aa  225  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5356  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
377 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.940445 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  28.47 
 
 
1014 aa  224  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0277  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.87 
 
 
957 aa  224  3e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105373  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  30.88 
 
 
1135 aa  224  4.9999999999999996e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.6 
 
 
914 aa  224  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
833 aa  224  6e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1212  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 
919 aa  223  8e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.979568  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
649 aa  223  9e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 
1550 aa  222  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4222  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 
922 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.588582  normal  0.325016 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  29.82 
 
 
847 aa  222  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 
1193 aa  221  3.9999999999999997e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
1767 aa  221  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0987  histidine kinase  29.73 
 
 
938 aa  220  6e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  27.8 
 
 
765 aa  220  7e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.17 
 
 
893 aa  219  8.999999999999998e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  30.92 
 
 
1418 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  31.04 
 
 
1417 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  29.11 
 
 
1287 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
1313 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.31 
 
 
929 aa  219  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4938  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.57 
 
 
686 aa  219  2e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.269297 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
816 aa  219  2e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
1771 aa  218  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3595  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
744 aa  218  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  27.95 
 
 
918 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  30.83 
 
 
950 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19340  putative sensor/response regulator hybrid  28.95 
 
 
918 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.51 
 
 
933 aa  218  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  29.62 
 
 
1765 aa  217  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1582 aa  217  7e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 
876 aa  216  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 
916 aa  216  9e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.66 
 
 
937 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4428  PAS sensor protein  30.47 
 
 
693 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.426756 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.41 
 
 
1763 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.85 
 
 
912 aa  215  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
1782 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3235  histidine kinase  28.9 
 
 
647 aa  215  1.9999999999999998e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
917 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
909 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.41 
 
 
1784 aa  214  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1252  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 
917 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.376653  hitchhiker  0.0000592891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 
1255 aa  214  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
812 aa  213  7e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
925 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  30.78 
 
 
754 aa  212  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.91 
 
 
1009 aa  212  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.68 
 
 
950 aa  212  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
1611 aa  212  2e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.02 
 
 
1442 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 
1397 aa  211  3e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  29.2 
 
 
852 aa  211  4e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4067  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.72 
 
 
917 aa  211  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.125923  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.99 
 
 
1792 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
920 aa  210  8e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
1786 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1031  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.47 
 
 
941 aa  209  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.581247  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  32.54 
 
 
1053 aa  209  1e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.14 
 
 
946 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.6 
 
 
1499 aa  209  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.35 
 
 
925 aa  208  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>