More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47365 on replicon NC_011681
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011681  PHATRDRAFT_47365  predicted protein  100 
 
 
603 aa  1246    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.776919  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38071  predicted protein  39.23 
 
 
431 aa  259  7e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.408738  normal  0.0884002 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31789  predicted protein  34.48 
 
 
436 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00179288  normal  0.0182063 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17862  predicted protein  32.49 
 
 
529 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.626563  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.44 
 
 
414 aa  154  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  33.87 
 
 
533 aa  152  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  30.71 
 
 
443 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  30.71 
 
 
447 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.33 
 
 
503 aa  150  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.23 
 
 
516 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_47095  predicted protein  31.58 
 
 
413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0903334  normal  0.0377209 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.02 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.37 
 
 
449 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_1703  nucleolar DEAD-box protein required for synthesis of 60S ribosomal subunits  32.65 
 
 
672 aa  148  3e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1273  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.05 
 
 
456 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163925 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.58 
 
 
565 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.86 
 
 
474 aa  147  6e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39714  predicted protein  30.09 
 
 
531 aa  147  7.0000000000000006e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
447 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 
449 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  29.3 
 
 
552 aa  146  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2514  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.1 
 
 
449 aa  146  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.28 
 
 
623 aa  145  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  32.23 
 
 
452 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.73 
 
 
450 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.83 
 
 
449 aa  145  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  29.12 
 
 
530 aa  145  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.28 
 
 
622 aa  144  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.28 
 
 
622 aa  144  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2445  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.05 
 
 
451 aa  144  5e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.959093  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  29.5 
 
 
481 aa  143  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  31.23 
 
 
656 aa  143  9.999999999999999e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.28 
 
 
619 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.15 
 
 
508 aa  142  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.78 
 
 
640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
640 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
449 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.79 
 
 
527 aa  142  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  32.11 
 
 
601 aa  141  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.07 
 
 
565 aa  141  3.9999999999999997e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.52 
 
 
599 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.164038 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  31.41 
 
 
491 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1417  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.87 
 
 
468 aa  141  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0306268  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  31.41 
 
 
482 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.46 
 
 
637 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 
640 aa  140  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2893  DEAD/DEAH box helicase-like  31.44 
 
 
423 aa  140  6e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  31.48 
 
 
452 aa  140  8.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1158  ATP-dependent RNA helicase  31.44 
 
 
447 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0413431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.36 
 
 
488 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.308485  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  31.65 
 
 
469 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.69 
 
 
465 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0491  ATP-dependent RNA helicase RhlE  31.46 
 
 
450 aa  139  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.14662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.56 
 
 
451 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0657  ATP-dependent RNA helicase  29.57 
 
 
450 aa  139  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1200  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.9 
 
 
565 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0324771  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1660  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
451 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1645  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
451 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1682  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.56 
 
 
451 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.747215  normal  0.719236 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  29.52 
 
 
447 aa  139  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12760  ATP-dependent RNA helicase  32.47 
 
 
449 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00382469  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0299  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.73 
 
 
364 aa  138  2e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265949  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  30.71 
 
 
476 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  30.82 
 
 
435 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2755  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.52 
 
 
472 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0813357  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.25 
 
 
448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.4 
 
 
618 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.59 
 
 
439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2624  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.44 
 
 
448 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.394652  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  31.9 
 
 
611 aa  137  4e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.3 
 
 
456 aa  138  4e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.27 
 
 
506 aa  137  5e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 
454 aa  137  5e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2025  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.19 
 
 
400 aa  137  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000222317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0608  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.26 
 
 
421 aa  137  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
599 aa  137  5e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0882  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  29.49 
 
 
439 aa  137  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.18261  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  31.09 
 
 
477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.68 
 
 
634 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  31.25 
 
 
589 aa  137  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0439  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.61 
 
 
441 aa  137  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.95 
 
 
611 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.49 
 
 
466 aa  136  9e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.53 
 
 
634 aa  136  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3215  putative ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.87 
 
 
448 aa  136  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  31.5 
 
 
543 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1743  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.25 
 
 
479 aa  136  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.236928 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1799  DEAD/DEAH box helicase-like  33.86 
 
 
472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2955  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.28 
 
 
487 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38897  predicted protein  30.43 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213281  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8393  hypothetical protein  28.71 
 
 
697 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.671179 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.73 
 
 
598 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.33 
 
 
560 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_12990  predicted protein  28.18 
 
 
500 aa  134  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.368235  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.8 
 
 
581 aa  135  3e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.72 
 
 
515 aa  135  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.72 
 
 
515 aa  135  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3042  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.83 
 
 
478 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00902237  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>