More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_38897 on replicon NC_009359
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009359  OSTLU_38897  predicted protein  100 
 
 
437 aa  895    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213281  normal  0.515123 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_87146  predicted protein  41.22 
 
 
480 aa  272  1e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000232549  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55603  ATP-dependent RNA helicase of DEAD box family  40.15 
 
 
616 aa  259  7e-68  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_2097  predicted protein  38.54 
 
 
552 aa  259  9e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143499  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10557  ATP-dependent RNA helicase ded1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P0C2M6]  40.24 
 
 
668 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.645505 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07860  ATP-dependent RNA helicase ded1, putative  38.65 
 
 
637 aa  243  7e-63  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  43.32 
 
 
634 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.59 
 
 
504 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11320  DNA/RNA helicase, superfamily II  39.3 
 
 
582 aa  231  1e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.381496  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.62 
 
 
493 aa  231  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0919  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.78 
 
 
632 aa  229  7e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  41.44 
 
 
608 aa  229  9e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
509 aa  228  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.1 
 
 
493 aa  228  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2211  ATP-dependent RNA helicase protein  40.42 
 
 
495 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2582  DEAD/DEAH box helicase-like protein  38.07 
 
 
556 aa  227  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.33 
 
 
560 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.94 
 
 
627 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4603  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.67 
 
 
557 aa  226  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.884442  normal  0.136344 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.94 
 
 
627 aa  226  7e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2800  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.61 
 
 
408 aa  226  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0135587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.52 
 
 
507 aa  225  1e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.99 
 
 
678 aa  225  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  39.47 
 
 
482 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.8 
 
 
565 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.47 
 
 
482 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.47 
 
 
482 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  39.47 
 
 
481 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  39.47 
 
 
482 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  39.47 
 
 
482 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.69 
 
 
511 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.26 
 
 
482 aa  225  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.69 
 
 
497 aa  224  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  37.93 
 
 
571 aa  224  3e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  39.47 
 
 
559 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  40.58 
 
 
527 aa  223  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1166  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.24 
 
 
565 aa  223  4e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.269312  normal  0.400384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  37.15 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1807  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  36.28 
 
 
433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.527975  normal  0.043326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.79 
 
 
494 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000813647 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_1537  predicted protein  40.05 
 
 
394 aa  223  6e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.935265 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7264  DEAD/DEAH box helicase  40.91 
 
 
481 aa  223  6e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1773  DEAD/DEAH box helicase-like  39.53 
 
 
477 aa  223  6e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4569  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.37 
 
 
483 aa  223  6e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0474956 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2450  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.19 
 
 
508 aa  223  7e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0131519  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0514  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.72 
 
 
503 aa  223  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15280  DNA/RNA helicase, superfamily II  39.63 
 
 
611 aa  223  8e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.170483  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2339  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
520 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0312074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.64 
 
 
460 aa  222  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2316  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
520 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1704  DEAD/DEAH box helicase-like  40.73 
 
 
520 aa  222  9e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.37 
 
 
537 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.3 
 
 
484 aa  222  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7154  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.64 
 
 
479 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.557352 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  37.35 
 
 
510 aa  221  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.46 
 
 
532 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.67 
 
 
541 aa  222  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.05 
 
 
482 aa  221  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.174751 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3027  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.52 
 
 
414 aa  221  3e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.71 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5967  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.84 
 
 
477 aa  220  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.64 
 
 
507 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.110628 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.95 
 
 
489 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6264  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.37 
 
 
511 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  40.53 
 
 
540 aa  219  7.999999999999999e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  40 
 
 
492 aa  219  7.999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5192  DEAD/DEAH box helicase-like  39.84 
 
 
507 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3832  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.57 
 
 
516 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.425556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27750  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.43 
 
 
593 aa  219  1e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.417961  normal  0.390673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2478  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.77 
 
 
598 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0648201  hitchhiker  0.00334068 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.46 
 
 
487 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5691  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.42 
 
 
475 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.768989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  38.42 
 
 
491 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.03 
 
 
498 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.89 
 
 
465 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.8 
 
 
528 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  36.8 
 
 
528 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0943  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.92 
 
 
409 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.86 
 
 
433 aa  216  5e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3728  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.5 
 
 
447 aa  216  5e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.201471  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.86 
 
 
433 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.31 
 
 
550 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  35.94 
 
 
447 aa  216  7e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
433 aa  216  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0774  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.6 
 
 
605 aa  216  7e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
618 aa  216  8e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4297  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  38.55 
 
 
442 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.577839 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1417  DEAD/DEAH box helicase-like protein  36.77 
 
 
468 aa  216  8e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0306268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.59 
 
 
433 aa  216  8e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5193  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.84 
 
 
481 aa  216  9e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0459636 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05931  ATP-dependent RNA helicase dbp2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0J9]  37.4 
 
 
563 aa  215  9.999999999999999e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111979  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4980  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.32 
 
 
626 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2906  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.3 
 
 
580 aa  215  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.109647  normal  0.0319013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2833  DEAD/DEAH box helicase-like  38.77 
 
 
503 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.900807  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0485  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.2 
 
 
630 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4853  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.32 
 
 
627 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.282261  normal  0.0691248 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2445  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.77 
 
 
451 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.959093  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0773  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.11 
 
 
502 aa  215  9.999999999999999e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.463701 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0916  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.97 
 
 
671 aa  214  1.9999999999999998e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0853384  normal  0.398163 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.93 
 
 
530 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>