More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_39714 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_39714  predicted protein  100 
 
 
531 aa  1090    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31789  predicted protein  36.56 
 
 
436 aa  276  9e-73  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00179288  normal  0.0182063 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1950  DEAD/DEAH box helicase-like protein  31.09 
 
 
522 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.86 
 
 
441 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.27 
 
 
541 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 
546 aa  178  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.51 
 
 
504 aa  178  2e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.54 
 
 
678 aa  177  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1913  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.22 
 
 
505 aa  177  3e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.857916 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.29 
 
 
546 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.63 
 
 
521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308058  decreased coverage  0.00839171 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4353  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.18 
 
 
519 aa  173  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.807247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0938  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.44 
 
 
482 aa  173  7.999999999999999e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.556655  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4464  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.22 
 
 
501 aa  173  9e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.414589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.3 
 
 
487 aa  172  1e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  29.79 
 
 
492 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0933  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  29.44 
 
 
482 aa  172  1e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3984  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.66 
 
 
519 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.950119 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3323  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.02 
 
 
465 aa  171  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.469232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  31.52 
 
 
506 aa  171  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4759  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.73 
 
 
537 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00346691 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.32 
 
 
516 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.105458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2985  DEAD/DEAH box helicase  29.86 
 
 
516 aa  171  4e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0305282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2536  ATP-dependent helicase, DEAD-box  28.32 
 
 
518 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314913  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1987  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.48 
 
 
507 aa  169  9e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.173393  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.47 
 
 
486 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.32 
 
 
491 aa  169  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4333  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.57 
 
 
482 aa  169  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.341636 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.64 
 
 
529 aa  168  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5283  DEAD/DEAH box helicase-like  29.3 
 
 
622 aa  167  4e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.77 
 
 
489 aa  167  5e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2463  DEAD/DEAH box helicase-like  29.64 
 
 
500 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.710449  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0420  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.85 
 
 
628 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2431  ATP-dependent RNA helicase  28.21 
 
 
516 aa  166  6.9999999999999995e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  27.56 
 
 
510 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.28 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2249  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.67 
 
 
498 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.09 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.05 
 
 
535 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5070  ATP-dependent RNA helicase rhlE, putative  29.96 
 
 
629 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0458  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  29.52 
 
 
629 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0999  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.63 
 
 
527 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.431733  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2718  DEAD/DEAH box helicase  28.12 
 
 
799 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.370248  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.98 
 
 
538 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  28.85 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1324  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
498 aa  165  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.695587  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28 
 
 
545 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  28.31 
 
 
606 aa  164  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1333  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.96 
 
 
493 aa  164  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.218178  normal  0.0904092 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  29.2 
 
 
559 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  30.05 
 
 
481 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.51 
 
 
471 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000222801  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
525 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.05 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  30.05 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.05 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.91 
 
 
438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  30.05 
 
 
571 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  30.05 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  30.05 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.73 
 
 
509 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05933  hypothetical protein  28.8 
 
 
421 aa  164  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.24 
 
 
511 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
526 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.44 
 
 
525 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.2 
 
 
497 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.6 
 
 
515 aa  163  6e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2926  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.9 
 
 
468 aa  163  6e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000199  ATP-dependent RNA helicase  28.57 
 
 
419 aa  163  7e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00545239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1312  putative helicase (DEAD/DEAH box helicase)  29.02 
 
 
434 aa  163  7e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.539045  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.8 
 
 
664 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.8 
 
 
664 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.81 
 
 
511 aa  163  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1200  DEAD/DEAH box helicase-like  26.99 
 
 
644 aa  163  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.994083  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.05 
 
 
550 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 
584 aa  162  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1478  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.6 
 
 
499 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142934  hitchhiker  0.00960181 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  29.8 
 
 
664 aa  162  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.76 
 
 
418 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.684859 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.34 
 
 
484 aa  162  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.49 
 
 
677 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  29.33 
 
 
527 aa  162  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.17 
 
 
513 aa  161  2e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  27.99 
 
 
493 aa  162  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  28.96 
 
 
625 aa  162  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0808  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.21 
 
 
448 aa  161  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.22 
 
 
494 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.67 
 
 
528 aa  162  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.989648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.09 
 
 
482 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  29.67 
 
 
476 aa  161  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2391  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.92 
 
 
462 aa  161  3e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.914149  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0891  DEAD/DEAH box helicase-like protein  27.22 
 
 
473 aa  161  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.51 
 
 
440 aa  161  3e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.69 
 
 
626 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  28.96 
 
 
632 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.09 
 
 
471 aa  161  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.14 
 
 
436 aa  161  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1258  DEAD/DEAH box helicase-like protein  28.15 
 
 
456 aa  160  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.410672 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.64 
 
 
443 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  28.73 
 
 
653 aa  160  4e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>