More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0185 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
418 aa  855    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.684859 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1658  DEAD box-related helicase (ATP-dependent RNA helicase)  56.04 
 
 
437 aa  458  9.999999999999999e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0074  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.55 
 
 
481 aa  427  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3971  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.77 
 
 
444 aa  421  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160795  normal  0.568065 
 
 
-
 
NC_002950  PG2099  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  49.03 
 
 
427 aa  407  1.0000000000000001e-112  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.707373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1766  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.52 
 
 
535 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910264  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.86 
 
 
447 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000930018  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3293  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.82 
 
 
471 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000048644  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0954  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.81 
 
 
453 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.756474 
 
 
-
 
NC_002936  DET0183  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.66 
 
 
560 aa  318  1e-85  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.475928  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0754  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.02 
 
 
447 aa  315  9e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0016093  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_172  hypothetical protein  41.85 
 
 
561 aa  315  9.999999999999999e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000114775  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0944  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.81 
 
 
450 aa  312  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000132586  normal  0.320448 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0570  DNA/RNA helicase  40.05 
 
 
432 aa  313  4.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1278000000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3701  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.51 
 
 
467 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000590991  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2108  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.75 
 
 
418 aa  311  2e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2573  ATP-dependent RNA helicase RhlE  38.81 
 
 
451 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0628194  normal  0.940569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0418  DEAD/DEAH box helicase-like  42.63 
 
 
579 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0914  ATP-dependent RNA helicase RhlE  39.71 
 
 
447 aa  309  5.9999999999999995e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131359  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  39.53 
 
 
425 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.38 
 
 
415 aa  308  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1383  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.11 
 
 
433 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2618  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.14 
 
 
439 aa  306  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000143919  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3005  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.15 
 
 
445 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.18 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.18 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3310  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  43.62 
 
 
507 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.18 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.18 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.18 
 
 
453 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.15 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2892  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.84 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.15 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2988  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.84 
 
 
433 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0987  DEAD/DEAH box helicase-like  39.23 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.748999  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.58 
 
 
433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1022  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.6 
 
 
435 aa  302  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0284952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.02 
 
 
462 aa  302  7.000000000000001e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.89 
 
 
433 aa  302  9e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1148  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.94 
 
 
489 aa  302  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2555  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.64 
 
 
454 aa  301  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0820  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.64 
 
 
454 aa  300  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2349  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.52 
 
 
425 aa  301  2e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0862  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.64 
 
 
454 aa  300  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00764  RNA helicase  41.64 
 
 
454 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.697529  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2845  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.64 
 
 
454 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2846  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.64 
 
 
454 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0376153 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0945  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.64 
 
 
455 aa  300  3e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41 
 
 
403 aa  300  3e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0851  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.64 
 
 
454 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00781  hypothetical protein  41.64 
 
 
454 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.74748  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.76 
 
 
487 aa  300  4e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2952  DEAD/DEAH box helicase-like protein  39.66 
 
 
419 aa  300  4e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3068  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
433 aa  300  5e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.546349  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.11 
 
 
504 aa  299  6e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2015  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.44 
 
 
493 aa  299  7e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.73004  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3336  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.17 
 
 
429 aa  299  8e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0132236  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1590  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.52 
 
 
455 aa  298  9e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.44 
 
 
418 aa  298  9e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0917  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.16 
 
 
418 aa  298  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.577539  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1101  DEAD/DEAH box helicase  42.02 
 
 
460 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.173172  normal  0.740894 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0169  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.03 
 
 
561 aa  298  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000471101  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1556  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.52 
 
 
418 aa  297  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000449749  hitchhiker  0.000184572 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.01 
 
 
545 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.62 
 
 
433 aa  297  3e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0631  putative ATP-dependent RNA helicase 2  42.51 
 
 
494 aa  296  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.640854  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.25 
 
 
571 aa  296  5e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  39.56 
 
 
446 aa  296  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1807  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  40.79 
 
 
433 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.527975  normal  0.043326 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.25 
 
 
559 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.54 
 
 
514 aa  295  8e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2535  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.56 
 
 
436 aa  295  8e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.7 
 
 
504 aa  295  9e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.24 
 
 
441 aa  295  9e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2449  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.7 
 
 
485 aa  295  1e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727769  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2409  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.91 
 
 
493 aa  295  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.92601 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.25 
 
 
482 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2800  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.34 
 
 
408 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0135587 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  41.25 
 
 
482 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.22 
 
 
489 aa  295  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  41.25 
 
 
481 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  41.25 
 
 
482 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  41.25 
 
 
482 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1095  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.63 
 
 
432 aa  295  1e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3519  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.57 
 
 
436 aa  295  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1974  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40 
 
 
438 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000565888  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  41.25 
 
 
482 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  41.27 
 
 
589 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  41.27 
 
 
589 aa  294  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.13 
 
 
482 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  41.76 
 
 
492 aa  294  2e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0891  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.8 
 
 
473 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.15 
 
 
479 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  38.93 
 
 
426 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3043  DEAD/DEAH box helicase-like  39.16 
 
 
452 aa  294  3e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000626056  normal  0.930079 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.41 
 
 
492 aa  293  4e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.1 
 
 
473 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.74 
 
 
460 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.41988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>