More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3150 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2955  DEAD/DEAH box helicase-like protein  95.71 
 
 
487 aa  811    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3042  DEAD/DEAH box helicase domain protein  98.54 
 
 
478 aa  787    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00902237  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
488 aa  946    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.308485  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  68.62 
 
 
455 aa  551  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.101039  normal  0.788481 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0245  DEAD/DEAH box helicase-like protein  46.91 
 
 
463 aa  350  4e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283018  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0703  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.76 
 
 
494 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1240  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.92 
 
 
506 aa  347  2e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.502604  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7234  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.24 
 
 
506 aa  347  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.499446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7020  ATP-dependent RNA helicase  51.98 
 
 
469 aa  344  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.325131  normal  0.333376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  42.42 
 
 
543 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.53 
 
 
513 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.16 
 
 
525 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.57 
 
 
499 aa  341  2e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.56 
 
 
526 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0943  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.07 
 
 
409 aa  341  2e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.72 
 
 
506 aa  341  2e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3476  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.81 
 
 
437 aa  340  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.56 
 
 
525 aa  340  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  49.74 
 
 
477 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1028  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.47 
 
 
441 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0361604  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  47.87 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.55 
 
 
515 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.58 
 
 
571 aa  340  4e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.07 
 
 
479 aa  340  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  48.67 
 
 
491 aa  339  8e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3108  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.62 
 
 
550 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.66 
 
 
489 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1185  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.04 
 
 
414 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.505533 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1641  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.76 
 
 
439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00551625  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1244  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.37 
 
 
571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3703  DEAD/DEAH box helicase-like  49.08 
 
 
481 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.621227  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2135  DEAD/DEAH box helicase-like  43.05 
 
 
435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2082  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.2 
 
 
482 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.162291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.29 
 
 
515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2503  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.92 
 
 
506 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.817106 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.83 
 
 
474 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3520  DEAD/DEAH box helicase-like  45.5 
 
 
579 aa  336  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.119632 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.39 
 
 
497 aa  336  5e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.16 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  43.16 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  43.16 
 
 
559 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.53 
 
 
510 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  43.16 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3511  DEAD/DEAH box helicase-like  49.87 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.621785  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  43.16 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  43.16 
 
 
482 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  43.16 
 
 
481 aa  336  7e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3204  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
559 aa  336  7e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2571  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.53 
 
 
510 aa  335  7.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.948447  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  49.74 
 
 
491 aa  335  9e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5658  DEAD/DEAH box helicase-like  48.66 
 
 
527 aa  335  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.63 
 
 
549 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3497  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.34 
 
 
511 aa  333  3e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.87 
 
 
522 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.02 
 
 
443 aa  333  4e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1125  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  41.74 
 
 
466 aa  333  5e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1288  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.49 
 
 
462 aa  333  5e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0954  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.16 
 
 
515 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.846245 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1098  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.16 
 
 
515 aa  333  5e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3215  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.79 
 
 
477 aa  333  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2235  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.66 
 
 
511 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2355  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.66 
 
 
497 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651471  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3783  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  42.32 
 
 
535 aa  332  8e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0748  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.32 
 
 
485 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.162375  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0248  ATP-dependent RNA helicase RhlE  45.22 
 
 
485 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0914  ATP-dependent RNA helicase  45.32 
 
 
485 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.348859  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2460  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.22 
 
 
485 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0735  putative ATP-dependent RNA helicase rhlE  45.32 
 
 
485 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0961  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.4 
 
 
509 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0175474  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0400  DEAD/DEAH box helicase-like  43.75 
 
 
477 aa  331  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.89 
 
 
578 aa  331  2e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0517  helicase, C-terminal:Type III restriction enzyme, res subunit:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  48.79 
 
 
506 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0847838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03540  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family  48.55 
 
 
557 aa  330  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.897279  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0883  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.58 
 
 
453 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.809863  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0237  DEAD/DEAH box helicase-like  48.05 
 
 
498 aa  330  4e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  47.75 
 
 
429 aa  330  4e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.00000130647  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0855  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.58 
 
 
453 aa  330  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.02 
 
 
491 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.13 
 
 
383 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000182992  normal  0.30004 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0947  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.58 
 
 
453 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.283527  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0915  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.58 
 
 
453 aa  330  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1150  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.19 
 
 
418 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1433  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.19 
 
 
418 aa  329  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.858886  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0968  ATP-dependent RNA helicase RhlE  46.58 
 
 
453 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0314  DEAD/DEAH box helicase  48.95 
 
 
476 aa  329  7e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0142  putative ATP-dependent RNA helicase (DEAD/DEAH box helicase)  41.34 
 
 
495 aa  329  7e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.04 
 
 
403 aa  329  8e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3026  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.35 
 
 
496 aa  328  9e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0607  ATP-dependent RNA helicase RhlE  47.37 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2419  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.58 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  44.42 
 
 
540 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0899  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  47.63 
 
 
537 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1809  DEAD/DEAH box helicase-like  42.43 
 
 
493 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0916178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1362  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.89 
 
 
469 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3129  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.63 
 
 
549 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2379  ATP-dependent RNA helicase RhlE  44.89 
 
 
488 aa  327  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.17 
 
 
560 aa  327  3e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2657  DEAD/DEAH box helicase-like  42.83 
 
 
510 aa  327  3e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0985  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.71 
 
 
463 aa  327  3e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.91 
 
 
514 aa  327  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>