More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_17341 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 244 aa  491  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  93.44 
 
 		 243 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  93.44 
 
 		 243 aa  461  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  91.39 
 
 		 243 aa  452  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  88.38 
 
 		 243 aa  437  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  87.55 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  87.55 
 
 		 244 aa  428  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  85.83 
 
 		 242 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  83.33 
 
 		 242 aa  416  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  84.58 
 
 		 242 aa  398  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  67.77 
 
 		 244 aa  297  9e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  64.58 
 
 		 240 aa  284  9e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  64.35 
 
 		 242 aa  276  2e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  67.57 
 
 		 251 aa  276  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  65.62 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  63.31 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  63.31 
 
 		 241 aa  270  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  61.83 
 
 		 252 aa  268  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  53.12 
 
 		 256 aa  241  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 228 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 228 aa  241  9e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  50 
 
 		 231 aa  239  2.9999999999999997e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  238  6.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 261 aa  237  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 236 aa  235  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  49.35 
 
 		 228 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  49.35 
 
 		 228 aa  235  6e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  49.35 
 
 		 228 aa  235  6e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 221 aa  235  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 232 aa  234  1.0000000000000001e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  51.15 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  53.52 
 
 		 232 aa  233  2.0000000000000002e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  51.15 
 
 		 240 aa  233  2.0000000000000002e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 286 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  48.48 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 223 aa  232  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  47.97 
 
 		 237 aa  231  6e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 244 aa  231  8.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 244 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  47.23 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 220 aa  231  1e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  51.64 
 
 		 219 aa  230  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  48.07 
 
 		 229 aa  229  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  50.69 
 
 		 239 aa  229  2e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 214 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 217 aa  229  2e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 226 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  48.31 
 
 		 230 aa  228  5e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  47.15 
 
 		 241 aa  228  7e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 238 aa  228  8e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 219 aa  228  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 238 aa  227  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  48 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 218 aa  227  1e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  49.31 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  47.64 
 
 		 229 aa  227  2e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  47.21 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  51.63 
 
 		 243 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  48.85 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  47.21 
 
 		 229 aa  227  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 243 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 230 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 218 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  47.75 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  47.44 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 212 aa  226  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 224 aa  226  3e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 233 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  51.4 
 
 		 236 aa  226  4e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 233 aa  226  4e-58  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  51.17 
 
 		 232 aa  225  4e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 226 aa  226  4e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 240 aa  224  6e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  46.35 
 
 		 229 aa  225  6e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 236 aa  225  6e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 231 aa  224  9e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 237 aa  224  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  46.35 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 271 aa  224  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  48.85 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 233 aa  224  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  51.87 
 
 		 235 aa  224  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  49.53 
 
 		 210 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  46.61 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>