More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_23081 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  89.67 
 
 		 242 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  90.12 
 
 		 244 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  90.08 
 
 		 244 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  88.84 
 
 		 243 aa  438  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  87.97 
 
 		 243 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  87.97 
 
 		 243 aa  435  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  87.14 
 
 		 243 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  91.32 
 
 		 242 aa  428  1e-119  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  85.83 
 
 		 244 aa  424  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  66.8 
 
 		 244 aa  289  2e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  63.9 
 
 		 240 aa  284  8e-76  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  62.55 
 
 		 242 aa  279  3e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  63.49 
 
 		 251 aa  271  8.000000000000001e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  65.7 
 
 		 241 aa  266  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  65.7 
 
 		 241 aa  266  1e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  65.33 
 
 		 260 aa  266  2e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  64.29 
 
 		 252 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 228 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  51.08 
 
 		 228 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  51.08 
 
 		 228 aa  237  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  50 
 
 		 231 aa  234  9e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  51.34 
 
 		 261 aa  234  9e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  52.79 
 
 		 256 aa  234  9e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  53.3 
 
 		 226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  53.3 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  54.25 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.78 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  49.35 
 
 		 228 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  53.77 
 
 		 230 aa  229  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  48.93 
 
 		 229 aa  228  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  48.92 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  48.92 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  48.92 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  48.32 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  49.59 
 
 		 239 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  50.85 
 
 		 244 aa  227  1e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  52.58 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 223 aa  226  3e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  48.89 
 
 		 286 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 238 aa  225  4e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  47.66 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  225  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  52.07 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  51.15 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  51.15 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  48.07 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  49.14 
 
 		 229 aa  224  1e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  48.68 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  51.14 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  48.26 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 219 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  48.26 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  48.71 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  48.07 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  49.56 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  48.5 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 230 aa  223  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  50.69 
 
 		 228 aa  223  2e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 228 aa  222  3e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  48.88 
 
 		 223 aa  221  4.9999999999999996e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  48.89 
 
 		 308 aa  221  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0333  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000255455  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0282  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000274054  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  46.96 
 
 		 295 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3453  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000212964  decreased coverage  0.00445176 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2753  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000356119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0273  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00291944  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0059  ribosomal protein S3  50 
 
 		 275 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000192317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  50 
 
 		 271 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0354  30S ribosomal protein S3  49.06 
 
 		 266 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000020511  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  52.36 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  52.36 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  51.15 
 
 		 240 aa  219  1.9999999999999999e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  52.36 
 
 		 243 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  46.64 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 232 aa  219  1.9999999999999999e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 232 aa  220  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>