More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0370 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 242 aa  488  1e-137  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  94.63 
 
 		 242 aa  466  9.999999999999999e-131  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  91.32 
 
 		 242 aa  450  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  89.26 
 
 		 243 aa  441  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  88.07 
 
 		 244 aa  434  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  86.72 
 
 		 243 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  88.02 
 
 		 244 aa  432  1e-120  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  86.72 
 
 		 243 aa  431  1e-120  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  85.06 
 
 		 243 aa  425  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  84.58 
 
 		 244 aa  418  1e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  69.26 
 
 		 244 aa  304  9.000000000000001e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  65.15 
 
 		 240 aa  289  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  63.79 
 
 		 242 aa  287  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  65.08 
 
 		 251 aa  278  7e-74  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  66.53 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  66.53 
 
 		 241 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  65.93 
 
 		 260 aa  271  6e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  63.57 
 
 		 252 aa  271  8.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  53.25 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  53.25 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  51.98 
 
 		 236 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  51.65 
 
 		 239 aa  241  7e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  50.85 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 261 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  51.08 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 226 aa  238  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  51.95 
 
 		 256 aa  238  5.999999999999999e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  51.52 
 
 		 228 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  51.52 
 
 		 228 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  51.52 
 
 		 228 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  51.52 
 
 		 228 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  55.4 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  51.33 
 
 		 226 aa  236  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 238 aa  236  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  53.67 
 
 		 223 aa  236  3e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  52.53 
 
 		 221 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 240 aa  235  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  50.65 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  53.3 
 
 		 244 aa  234  8e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 230 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 227 aa  234  1.0000000000000001e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  53.07 
 
 		 236 aa  233  2.0000000000000002e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 232 aa  232  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  52.84 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  52.84 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  52.84 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 223 aa  231  8.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 286 aa  231  8.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  51.75 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  52.4 
 
 		 243 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  54.46 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 232 aa  230  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3638  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 268 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000231617  hitchhiker  0.0000000000213568 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 220 aa  230  2e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  50.43 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 229 aa  230  2e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  50.43 
 
 		 236 aa  229  2e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  50 
 
 		 230 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  50.69 
 
 		 301 aa  229  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 237 aa  229  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 232 aa  229  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 229 aa  229  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0320  30S ribosomal protein S3  48.26 
 
 		 268 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000941491  decreased coverage  0.00272793 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 231 aa  228  4e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2834  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 264 aa  229  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000988121  normal  0.306449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 240 aa  228  5e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0333  30S ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000255455  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  47.77 
 
 		 295 aa  228  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3453  30S ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000212964  decreased coverage  0.00445176 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  47.11 
 
 		 241 aa  228  5e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2753  30S ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000356119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0282  30S ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000274054  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0273  30S ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00291944  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0354  30S ribosomal protein S3  48.28 
 
 		 266 aa  228  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000020511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  51.61 
 
 		 232 aa  228  6e-59  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  52.36 
 
 		 244 aa  228  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0059  ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000192317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 271 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  52.51 
 
 		 232 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  50.63 
 
 		 252 aa  228  7e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 230 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  52.51 
 
 		 235 aa  228  8e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  51.89 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3062  30S ribosomal protein S3  49.54 
 
 		 266 aa  227  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000122398  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0591  30S ribosomal protein S3  51.57 
 
 		 247 aa  227  1e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  48.5 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>