More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2226 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 244 aa  487  1e-137  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  69.26 
 
 		 242 aa  343  1e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  68.31 
 
 		 243 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  68.31 
 
 		 243 aa  343  2e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  67.77 
 
 		 244 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  67.62 
 
 		 242 aa  341  5e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  67.9 
 
 		 243 aa  341  5.999999999999999e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  66.39 
 
 		 244 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  66.8 
 
 		 243 aa  340  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  66.26 
 
 		 244 aa  339  2.9999999999999998e-92  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  75.41 
 
 		 242 aa  336  1.9999999999999998e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  66.8 
 
 		 242 aa  335  2.9999999999999997e-91  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  76.54 
 
 		 240 aa  332  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  75.4 
 
 		 251 aa  313  9.999999999999999e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  76.34 
 
 		 260 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  72.62 
 
 		 252 aa  310  9e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  74.18 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  74.18 
 
 		 241 aa  300  1e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  50.45 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 236 aa  246  2e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 222 aa  246  3e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 243 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  50.69 
 
 		 219 aa  244  8e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  53.77 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  50.88 
 
 		 237 aa  242  5e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 247 aa  241  5e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  51.82 
 
 		 228 aa  241  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 219 aa  240  1e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 211 aa  239  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 214 aa  240  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 219 aa  240  2e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  53.55 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 228 aa  239  2.9999999999999997e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  52.56 
 
 		 218 aa  239  4e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 211 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  49.34 
 
 		 224 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 239 aa  239  4e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 224 aa  238  4e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 240 aa  238  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 221 aa  238  5e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 235 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  51.72 
 
 		 232 aa  237  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  49.32 
 
 		 224 aa  236  2e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  54.72 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  51.72 
 
 		 232 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 240 aa  236  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 219 aa  236  3e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  51.29 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 217 aa  235  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  50 
 
 		 220 aa  236  4e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 228 aa  235  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  50.69 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 241 aa  235  4e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  50.69 
 
 		 226 aa  235  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 238 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 238 aa  235  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  51.49 
 
 		 236 aa  235  6e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 217 aa  234  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  49.56 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  50.44 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  49.56 
 
 		 228 aa  234  7e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 256 aa  234  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 238 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  52.73 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  53.3 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  47.47 
 
 		 220 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 248 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 239 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 249 aa  233  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 286 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 210 aa  232  3e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 224 aa  233  3e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 248 aa  233  3e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  50 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 228 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>