More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3709 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 240 aa  480  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  84.58 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  84.58 
 
 		 241 aa  351  5e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  74.9 
 
 		 242 aa  331  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  66.39 
 
 		 243 aa  328  4e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  66.39 
 
 		 243 aa  328  4e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  65.98 
 
 		 243 aa  327  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  65.15 
 
 		 242 aa  325  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  63.9 
 
 		 243 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  64.58 
 
 		 244 aa  322  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  79.39 
 
 		 260 aa  322  4e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  63.93 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  63.93 
 
 		 244 aa  321  7e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  65.15 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  63.9 
 
 		 242 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  76.89 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  76.13 
 
 		 244 aa  318  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  73.02 
 
 		 252 aa  304  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  54.78 
 
 		 236 aa  256  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  53.64 
 
 		 221 aa  250  1e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  54.78 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  54.78 
 
 		 228 aa  249  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 228 aa  246  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  56.74 
 
 		 218 aa  246  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  55.16 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  54.71 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  55.16 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  55.16 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  55.16 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  55.35 
 
 		 226 aa  244  9e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  55.3 
 
 		 219 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  53.18 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  51.3 
 
 		 256 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 224 aa  243  3e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  53.04 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 245 aa  242  3.9999999999999997e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  52.32 
 
 		 235 aa  242  3.9999999999999997e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 218 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  53.45 
 
 		 233 aa  242  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  52.38 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  53.04 
 
 		 230 aa  241  7e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  51.95 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  51.95 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  51.95 
 
 		 232 aa  241  9e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  52.16 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  52.56 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  53.7 
 
 		 214 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 218 aa  240  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  52.16 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 219 aa  241  1e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 222 aa  240  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  51.74 
 
 		 288 aa  240  2e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  54.35 
 
 		 229 aa  240  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 223 aa  240  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 220 aa  239  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  52.31 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  58.29 
 
 		 212 aa  239  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 217 aa  240  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 243 aa  240  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  51.74 
 
 		 288 aa  239  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  54.29 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  54.76 
 
 		 237 aa  239  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  51.72 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  53.28 
 
 		 229 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 232 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  51.49 
 
 		 232 aa  238  8e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  52.8 
 
 		 217 aa  238  9e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  54.38 
 
 		 219 aa  238  9e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 229 aa  237  1e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  51.57 
 
 		 286 aa  237  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  53.92 
 
 		 219 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  56.13 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>