More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1298 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 252 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  79.53 
 
 		 251 aa  325  4.0000000000000003e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  71.71 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  80.95 
 
 		 260 aa  320  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  64.96 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  64.96 
 
 		 243 aa  320  9.999999999999999e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  65.1 
 
 		 244 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  62.85 
 
 		 244 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  65.61 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  64.57 
 
 		 243 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  72.62 
 
 		 240 aa  317  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  63.1 
 
 		 244 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  63.89 
 
 		 243 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  64.68 
 
 		 242 aa  313  9.999999999999999e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  64.68 
 
 		 242 aa  311  4.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  72.62 
 
 		 244 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  72.22 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  72.22 
 
 		 241 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  51.35 
 
 		 219 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  48.67 
 
 		 221 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  51.57 
 
 		 214 aa  233  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 222 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 222 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 228 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 243 aa  231  6e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 237 aa  231  7.000000000000001e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  47.44 
 
 		 226 aa  231  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 243 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  48.25 
 
 		 222 aa  231  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  48.56 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  52.51 
 
 		 219 aa  229  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 228 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  51.79 
 
 		 261 aa  229  3e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  48.86 
 
 		 222 aa  229  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  47.56 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 219 aa  228  5e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  48.51 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  48.51 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  48.51 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0633  ribosomal protein S3  49.16 
 
 		 279 aa  228  6e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  51.11 
 
 		 219 aa  228  6e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  52.68 
 
 		 256 aa  228  8e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  51.12 
 
 		 218 aa  228  8e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 228 aa  228  9e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  51.56 
 
 		 223 aa  228  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 286 aa  227  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  47.74 
 
 		 230 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  48.29 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2653  ribosomal protein S3  51.58 
 
 		 276 aa  226  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  51.34 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  49.33 
 
 		 245 aa  226  3e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2626  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0741143  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3770  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000624926  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3484  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00131963  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3798  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3740  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1930  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000560778  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  47.26 
 
 		 229 aa  226  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3163  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161585  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  48.86 
 
 		 218 aa  226  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  47.95 
 
 		 231 aa  225  4e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3638  30S ribosomal protein S3  48.51 
 
 		 268 aa  225  4e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000231617  hitchhiker  0.0000000000213568 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  51.11 
 
 		 219 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  48.5 
 
 		 244 aa  225  5.0000000000000005e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3062  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000122398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0320  30S ribosomal protein S3  48.51 
 
 		 268 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000941491  decreased coverage  0.00272793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  46.44 
 
 		 229 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0255  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132359  normal  0.0208099 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  47.86 
 
 		 228 aa  224  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  45.04 
 
 		 233 aa  224  8e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2834  30S ribosomal protein S3  49.55 
 
 		 264 aa  224  8e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000988121  normal  0.306449 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  48.1 
 
 		 229 aa  224  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2944  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 264 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012288  decreased coverage  0.000000133007 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  47.37 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3291  30S ribosomal protein S3  48.94 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000159884  hitchhiker  0.00000252184 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  47.81 
 
 		 217 aa  224  1e-57  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>