More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0697 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 260 aa  518  1e-146  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  94.06 
 
 		 251 aa  373  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  71.92 
 
 		 242 aa  338  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  75.38 
 
 		 240 aa  337  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  77.19 
 
 		 252 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  62.84 
 
 		 244 aa  324  9e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  62.84 
 
 		 242 aa  323  2e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  62.69 
 
 		 243 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  62.69 
 
 		 243 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  62.69 
 
 		 243 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  61.92 
 
 		 244 aa  322  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  62.45 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  61 
 
 		 244 aa  315  5e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  60.54 
 
 		 243 aa  314  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  62.45 
 
 		 242 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  72.8 
 
 		 244 aa  313  1.9999999999999998e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  76.65 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  76.65 
 
 		 241 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  51.46 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  48.76 
 
 		 247 aa  241  7e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  51.54 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  51.54 
 
 		 224 aa  240  1e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  52.07 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  50.66 
 
 		 224 aa  239  4e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  51.13 
 
 		 219 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  52.25 
 
 		 219 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  50.66 
 
 		 224 aa  238  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 221 aa  238  1e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  52.51 
 
 		 218 aa  237  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  51.57 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 222 aa  237  1e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  51.21 
 
 		 244 aa  237  2e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  50.43 
 
 		 286 aa  236  3e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  51.06 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  52.04 
 
 		 218 aa  235  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  52.31 
 
 		 214 aa  235  5.0000000000000005e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  54.17 
 
 		 218 aa  235  6e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 223 aa  235  6e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  51.8 
 
 		 243 aa  234  7e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  51.8 
 
 		 243 aa  234  8e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 228 aa  234  9e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 261 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  49.17 
 
 		 231 aa  233  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  52.78 
 
 		 220 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  51.85 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  51.6 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  51.35 
 
 		 237 aa  233  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  51.35 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  53 
 
 		 229 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  49.6 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  51.58 
 
 		 224 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  53.46 
 
 		 230 aa  233  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  50.23 
 
 		 217 aa  232  4.0000000000000004e-60  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  53.46 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  53.46 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  53.46 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  53.46 
 
 		 230 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  50.9 
 
 		 219 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  51.6 
 
 		 224 aa  232  5e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  50 
 
 		 288 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  50.46 
 
 		 222 aa  232  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  50 
 
 		 288 aa  232  6e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  49.77 
 
 		 211 aa  231  7.000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  47.95 
 
 		 245 aa  231  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  50.68 
 
 		 217 aa  231  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 228 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 229 aa  231  9e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  49.14 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  49.14 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  48.13 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  53 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  49.14 
 
 		 228 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  48.74 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  49.57 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  53 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 229 aa  230  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  48.13 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  48.56 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  51.39 
 
 		 226 aa  231  1e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  50 
 
 		 237 aa  230  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  53 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  53 
 
 		 230 aa  230  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  51.58 
 
 		 232 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>