More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3006 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_3006  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220868  hitchhiker  0.00714426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3709  30S ribosomal protein S3  75.62 
 
 		 240 aa  325  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1961  30S ribosomal protein S3  63.79 
 
 		 242 aa  321  5e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2565  30S ribosomal protein S3  74.5 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0697  30S ribosomal protein S3  78.54 
 
 		 260 aa  317  2e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00415861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1644  30S ribosomal protein S3  62.81 
 
 		 243 aa  316  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17591  30S ribosomal protein S3  62.81 
 
 		 243 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17431  30S ribosomal protein S3  62.81 
 
 		 243 aa  315  3e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1123  30S ribosomal protein S3  62.96 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19971  30S ribosomal protein S3  62.81 
 
 		 244 aa  313  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16721  30S ribosomal protein S3  61.32 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2226  30S ribosomal protein S3  74.59 
 
 		 244 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82226  normal  0.910265 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23081  30S ribosomal protein S3  62.55 
 
 		 242 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0370  30S ribosomal protein S3  63.37 
 
 		 242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.673285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17341  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 244 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.361315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0246  30S ribosomal protein S3  73.86 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0243  30S ribosomal protein S3  73.86 
 
 		 241 aa  303  2.0000000000000002e-81  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1298  30S ribosomal protein S3  71.71 
 
 		 252 aa  301  8.000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.180508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  52.56 
 
 		 214 aa  242  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  52.17 
 
 		 236 aa  241  7e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 222 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 222 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 222 aa  238  5.999999999999999e-62  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  48.09 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  50.22 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  50.91 
 
 		 217 aa  237  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  48.17 
 
 		 221 aa  237  2e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  51.54 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  50.45 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  53.74 
 
 		 237 aa  236  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  50.91 
 
 		 217 aa  236  3e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 221 aa  234  7e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 218 aa  234  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  48.44 
 
 		 226 aa  234  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0852  30S ribosomal protein S3  50.45 
 
 		 228 aa  234  9e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.13 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.13 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  52.61 
 
 		 218 aa  234  1.0000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  50.67 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.13 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.13 
 
 		 228 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  48.7 
 
 		 228 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 224 aa  233  2.0000000000000002e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  51.43 
 
 		 226 aa  233  3e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  50.7 
 
 		 261 aa  231  5e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 221 aa  232  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 249 aa  231  5e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  49.3 
 
 		 219 aa  231  6e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 222 aa  231  9e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  48.71 
 
 		 230 aa  231  9e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  48.72 
 
 		 231 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 218 aa  230  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  230  1e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  51.43 
 
 		 210 aa  230  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  49.08 
 
 		 247 aa  229  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  49.12 
 
 		 230 aa  230  2e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  46.96 
 
 		 276 aa  230  2e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 217 aa  229  3e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  229  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 220 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  48.51 
 
 		 232 aa  229  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  47.66 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  47.66 
 
 		 288 aa  229  4e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 220 aa  228  5e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  47.66 
 
 		 233 aa  228  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  49.34 
 
 		 232 aa  228  5e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 224 aa  228  5e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  50.24 
 
 		 224 aa  228  6e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  48.46 
 
 		 229 aa  228  6e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  48.68 
 
 		 230 aa  228  6e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  48.51 
 
 		 232 aa  228  8e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  47.66 
 
 		 233 aa  228  8e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 243 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  49.11 
 
 		 244 aa  228  9e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  48.68 
 
 		 230 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  48.68 
 
 		 230 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  48.68 
 
 		 230 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  47.66 
 
 		 232 aa  228  9e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  48.68 
 
 		 230 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  45.74 
 
 		 278 aa  227  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 212 aa  227  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  51.9 
 
 		 243 aa  227  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  48.62 
 
 		 224 aa  226  2e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  47.48 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  47.48 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  48.02 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 223 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  47.48 
 
 		 232 aa  226  2e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>