More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4616 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4616  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 289 aa  593  1e-169  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2069  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.156662 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3109  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.1017  normal  0.129161 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3464  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.26806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2094  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4236  transcriptional regulator, LysR family  31.19 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4203  LysR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2847  LysR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.310868  normal  0.325567 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3014  LysR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 296 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.932582 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2182  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2041  LysR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2497  transcription regulator protein  32.18 
 
 		 321 aa  95.1  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.82783  normal  0.625013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2760  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 321 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.436538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2357  transcriptional regulator, LysR family  30.92 
 
 		 321 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0418601  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0119  transcriptional regulator, LysR family  26.28 
 
 		 316 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2590  LysR family transcriptional regulator  30 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614241  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0496  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 315 aa  91.7  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7088  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.87 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2111  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 298 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2197  LysR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.567497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8014  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1269  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.151838 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4993  LysR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 303 aa  89  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0133249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1243  LysR family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 298 aa  89  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5103  LysR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 403 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.223049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0699  LysR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 317 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0791561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4972  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 306 aa  88.2  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.884957  normal  0.156049 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3487  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.38 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4509  LysR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 298 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2001  LysR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 308 aa  87.8  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2342  LysR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 312 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000677  LysR-family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 293 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.708378  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3164  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.07 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3230  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.07 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000332914 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3346  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.07 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0358858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.07 
 
 		 311 aa  86.3  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000462598 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2788  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 292 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4442  LysR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 334 aa  85.9  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413506  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 307 aa  84.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1930  LysR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 297 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0417087 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2142  LysR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.90528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5518  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.192387  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0884  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1366  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 298 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3726  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.01 
 
 		 315 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.161263 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04720  Transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.245931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2416  LysR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4432  LysR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 323 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02687  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.35 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2986  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.35 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2988  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.66 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0261246 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02648  hypothetical protein  30.35 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0876  DNA-binding transcriptional regulator LysR  30.35 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2619  LysR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 297 aa  82.8  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0732  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.52 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1436  LysR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2546  LysR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.715041  normal  0.706169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0851  transcriptional regulator, LysR family  29.96 
 
 		 311 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3022  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.96 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3182  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.39 
 
 		 311 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1344  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.749958  normal  0.0693843 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6120  LysR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3285  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4770  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.08 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3821  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.19 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.503579  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0752  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.97 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0319733  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4752  LysR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 305 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2158  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3161  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.96 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1817  transcriptional regulator, LysR family  26.94 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3582  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3938  LysR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.090076  normal  0.740204 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2536  LysR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4245  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.69 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.332953  normal  0.0310844 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4109  DNA-binding transcriptional regulator LysR  29.57 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000450007 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3626  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.63 
 
 		 306 aa  80.1  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5404  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.74 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2536  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  25.38 
 
 		 329 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.941748  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4882  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.74 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3484  DNA-binding transcriptional regulator LysR  27.74 
 
 		 304 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.657517  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8322  transcriptional regulator LysR family  27.03 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.489992  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0838  DNA-binding transcriptional regulator LysR  28.57 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.101081 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0067  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 301 aa  77.8  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4115  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 302 aa  77  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.214102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4183  LysR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465046 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2704  Transcriptional regulator  22.56 
 
 		 304 aa  77  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.321039  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2081  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5316  LysR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4404  transcriptional regulator, LysR family  24.83 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3779  LysR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00152286 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3995  transcriptional regulator, LysR family  24.56 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3860  LysR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.722283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1758  transcriptional regulator, LysR family  25.19 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.068602  normal  0.477555 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1450  LysR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2930  LysR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 320 aa  75.5  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.686642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1379  transcriptional regulator CysB-like protein  29.54 
 
 		 316 aa  75.1  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3256  LysR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.14149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4932  transcriptional regulator, LysR family  25.51 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5108  transcriptional regulator, LysR family  23.89 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00133603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4381  LysR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 303 aa  74.3  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>