More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_119483 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_119483  DEAD-box helicase, probable  100 
 
 
446 aa  915    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.112592  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0076  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.95 
 
 
452 aa  150  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000113664  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05125  ATP-dependent RNA helicase  27.78 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001255  ATP-dependent RNA helicase  28.71 
 
 
443 aa  141  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1417  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.02 
 
 
468 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0306268  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14032  predicted protein  32.01 
 
 
467 aa  139  8.999999999999999e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3215  putative ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.93 
 
 
448 aa  138  2e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.571925  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0657  ATP-dependent RNA helicase  28.19 
 
 
450 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03180  ATP-dependent RNA helicase, putative  29.73 
 
 
701 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.524376  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1273  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.52 
 
 
456 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163925 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1594  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.33 
 
 
465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.509668  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0368  putative ATP-dependent RNA helicase  31.26 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00019163  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1537  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.04 
 
 
449 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.713304  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.07 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01939  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  27.03 
 
 
441 aa  133  6.999999999999999e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0271466  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03359  ATP-dependent RNA helicase  30.33 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.191775  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2838  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  30.14 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.82 
 
 
443 aa  131  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1698  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.54 
 
 
448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00759671  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0890  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.68 
 
 
408 aa  130  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0724766 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3035  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.69 
 
 
438 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000379043  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2444  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 
449 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000483539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2514  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.26 
 
 
449 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000164023 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0660  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.86 
 
 
406 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3053  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.9 
 
 
447 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.643926  normal  0.011472 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2294  hypothetical protein  29.27 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2267  hypothetical protein  29.27 
 
 
589 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4727  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.84 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.215295  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.3 
 
 
497 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0124  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.87 
 
 
437 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4097  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.27 
 
 
417 aa  128  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.872576  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  30.16 
 
 
492 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2606  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.78 
 
 
449 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.581519  hitchhiker  0.0000000487661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4192  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.71 
 
 
474 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004445  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.61 
 
 
407 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0454053  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00952  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.9 
 
 
407 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0892  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.93 
 
 
408 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.9005  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1733  DEAD/DEAH box helicase  28.46 
 
 
477 aa  127  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210981  normal  0.24417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0744  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.34 
 
 
411 aa  127  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1688  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.12 
 
 
509 aa  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.279594  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1645  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.91 
 
 
451 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.55741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1682  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.91 
 
 
451 aa  127  5e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.747215  normal  0.719236 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1660  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.91 
 
 
451 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.37 
 
 
529 aa  126  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.74 
 
 
507 aa  126  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1588  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.63 
 
 
403 aa  126  8.000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0287382 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01060  conserved hypothetical protein  27.58 
 
 
607 aa  126  9e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0340674  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2698  DEAD/DEAH box helicase domain protein  29.91 
 
 
451 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.029027  hitchhiker  0.0000852127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.54 
 
 
452 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3646  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.87 
 
 
419 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.45 
 
 
514 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81459  RNA-dependent helicase  30.26 
 
 
567 aa  125  2e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.3042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4573  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.08 
 
 
415 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.74 
 
 
483 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0905  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
525 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0896  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.04 
 
 
515 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3466  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
526 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10130  DNA/RNA helicase, superfamily II  28.96 
 
 
449 aa  124  3e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.526574 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1379  DEAD/DEAH box helicase-like  29.47 
 
 
552 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2742  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28 
 
 
613 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0870  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.04 
 
 
525 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_35694  ATP-dependent RNA helicase DBP6 (DEAD-box protein 6)  30.81 
 
 
591 aa  124  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.788268  normal  0.0369979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0887  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.09 
 
 
419 aa  124  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1852  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.3 
 
 
438 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.9 
 
 
423 aa  124  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1618  DEAD/DEAH box helicase-like  28.14 
 
 
447 aa  124  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3233  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.57 
 
 
420 aa  124  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  26.77 
 
 
405 aa  124  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2552  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.3 
 
 
430 aa  123  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0947  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.57 
 
 
420 aa  123  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.1 
 
 
460 aa  123  7e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000327397 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  26.18 
 
 
527 aa  123  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0430  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.15 
 
 
454 aa  123  8e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2445  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.66 
 
 
451 aa  123  8e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.959093  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05623  conserved hypothetical protein  26.18 
 
 
567 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0060242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.44 
 
 
506 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10010  DEAD/DEAH box ATP-dependent RNA helicase  30.85 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00123792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3088  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.31 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0248  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  28.99 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1279  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.31 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0871578 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1538  DEAD/DEAH box helicase domain protein  27.6 
 
 
436 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3241  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.31 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3098  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.31 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.872049  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00589  ATP-dependent RNA helicase dbp4 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BFU1]  26.51 
 
 
812 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.18 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.38 
 
 
397 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0840  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.56 
 
 
419 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1195  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  28.05 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 
490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3527  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.63 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0341  DEAD/DEAH box helicase-like  27.87 
 
 
529 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0103074  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.18 
 
 
489 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1793  DEAD/DEAH box helicase  28.25 
 
 
491 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.353288 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0037  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  27.89 
 
 
460 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  29.18 
 
 
480 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0886  DEAD/DEAH box helicase-like protein  29.09 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2779  DEAD/DEAH box helicase domain protein  28.15 
 
 
482 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000517174  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3452  ATP-dependent RNA helicase SrmB  27.63 
 
 
419 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0790  ATP-dependent RNA helicase SrmB  28.33 
 
 
420 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_1794  predicted protein  27.01 
 
 
421 aa  120  3e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00327182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>