More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0945 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  85.54 
 
 		 443 aa  712    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  78.21 
 
 		 452 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3035  ATP-dependent RNA helicase RhlB  85.54 
 
 		 438 aa  692    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000379043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 451 aa  919    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  77.1 
 
 		 490 aa  693    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  72.96 
 
 		 475 aa  659    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000426275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2779  DEAD/DEAH box helicase domain protein  77.11 
 
 		 482 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000517174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0735  DEAD helicase family protein  62.53 
 
 		 433 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0356  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.34 
 
 		 432 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.22 
 
 		 440 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2070  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.58 
 
 		 438 aa  436  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.181762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.23 
 
 		 430 aa  425  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2156  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.13 
 
 		 544 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2245  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.18 
 
 		 544 aa  414  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03716  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.89 
 
 		 574 aa  410  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3674  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.36 
 
 		 574 aa  406  1.0000000000000001e-112  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.91 
 
 		 429 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2582  DEAD/DEAH box helicase-like  50.97 
 
 		 431 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.1 
 
 		 428 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0449  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.88 
 
 		 432 aa  396  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002096  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.87 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895445  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.18 
 
 		 428 aa  394  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3928  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.36 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0399  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.85 
 
 		 436 aa  392  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.08 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.08 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.08 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.08 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3876  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.36 
 
 		 438 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.587664  hitchhiker  0.000145647 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0202  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 428 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.72 
 
 		 428 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0339  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.08 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.181774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0514  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.09 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0317755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4303  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.84 
 
 		 421 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0431153  normal  0.722207 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3951  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.12 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0411  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.22 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3432  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.16 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3614  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.22 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0461  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.96 
 
 		 434 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.388345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4069  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.12 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.341266 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 430 aa  391  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  50.12 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.12 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0407  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.82 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  50.12 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4109  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.4 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297113  hitchhiker  0.000114369 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4205  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.64 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  388  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.12 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.11 
 
 		 421 aa  386  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3215  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.81 
 
 		 439 aa  385  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0410  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.98 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00338  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.17 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2697  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.64 
 
 		 438 aa  383  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578293  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.37 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0509  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.17 
 
 		 423 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4036  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.17 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.269062  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0178  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.17 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.61 
 
 		 419 aa  374  1e-102  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0146  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.37 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00149472  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0620  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.96 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.84 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.74 
 
 		 423 aa  363  3e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.96 
 
 		 533 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.26 
 
 		 418 aa  350  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.38 
 
 		 489 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.77 
 
 		 507 aa  347  3e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.92 
 
 		 529 aa  346  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.12 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.12 
 
 		 480 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47 
 
 		 483 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.46 
 
 		 521 aa  342  5.999999999999999e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  48.01 
 
 		 492 aa  340  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3565  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.09 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1623  DEAD/DEAH box helicase-like protein  44.62 
 
 		 424 aa  334  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.7 
 
 		 383 aa  330  3e-89  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000481841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1070  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.79 
 
 		 483 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.79 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2119  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 		 452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637401  hitchhiker  0.000114297 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.77 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  42.79 
 
 		 540 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.08 
 
 		 426 aa  322  9.999999999999999e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3809  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.78 
 
 		 506 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.300559  normal  0.339526 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6484  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.13 
 
 		 499 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  0.838885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0328  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.31 
 
 		 497 aa  321  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.912648 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.32 
 
 		 513 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1646  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.13 
 
 		 545 aa  320  5e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.39 
 
 		 560 aa  320  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0604  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.39 
 
 		 491 aa  319  6e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631555 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.59 
 
 		 479 aa  319  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.85 
 
 		 515 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.74 
 
 		 565 aa  318  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0878  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.31 
 
 		 425 aa  317  2e-85  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.121425 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  44.86 
 
 		 527 aa  317  2e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2794  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.24 
 
 		 510 aa  317  3e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.15323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  39.29 
 
 		 543 aa  317  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.498001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>