More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3876 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_3951  ATP-dependent RNA helicase RhlB  99.77 
 
 		 438 aa  907    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0407  ATP-dependent RNA helicase RhlB  92.24 
 
 		 439 aa  845    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3928  ATP-dependent RNA helicase RhlB  100 
 
 		 438 aa  909    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4109  ATP-dependent RNA helicase RhlB  84.09 
 
 		 435 aa  765    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297113  hitchhiker  0.000114369 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3432  ATP-dependent RNA helicase RhlB  93.62 
 
 		 439 aa  857    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4069  ATP-dependent RNA helicase RhlB  99.77 
 
 		 438 aa  907    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.341266 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0399  ATP-dependent RNA helicase RhlB  84.47 
 
 		 436 aa  768    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0339  ATP-dependent RNA helicase RhlB  83.92 
 
 		 435 aa  749    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.181774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0449  ATP-dependent RNA helicase RhlB  87.09 
 
 		 432 aa  769    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3876  ATP-dependent RNA helicase RhlB  100 
 
 		 438 aa  909    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.587664  hitchhiker  0.000145647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0411  ATP-dependent RNA helicase RhlB  92.69 
 
 		 439 aa  847    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3614  ATP-dependent RNA helicase RhlB  92.69 
 
 		 439 aa  847    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0461  ATP-dependent RNA helicase RhlB  83.33 
 
 		 434 aa  734    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.388345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0514  ATP-dependent RNA helicase RhlB  83.75 
 
 		 441 aa  764    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0317755 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0410  ATP-dependent RNA helicase RhlB  92.24 
 
 		 439 aa  843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3215  ATP-dependent RNA helicase RhlB  82.5 
 
 		 439 aa  754    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002096  ATP-dependent RNA helicase RhlB  68.04 
 
 		 439 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895445  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00338  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.74 
 
 		 437 aa  604  9.999999999999999e-173  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0202  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.97 
 
 		 428 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2697  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.44 
 
 		 438 aa  598  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578293  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.74 
 
 		 428 aa  601  1e-170  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0178  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.06 
 
 		 428 aa  594  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  65.75 
 
 		 428 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  67.21 
 
 		 421 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  67.21 
 
 		 421 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  68.37 
 
 		 419 aa  595  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4036  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.06 
 
 		 428 aa  594  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.269062  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  67.21 
 
 		 421 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  67.21 
 
 		 421 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  66.74 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.74 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  66.74 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.74 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4205  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.21 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.74 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4303  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.98 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0431153  normal  0.722207 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  66.74 
 
 		 421 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.74 
 
 		 421 aa  591  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  65.9 
 
 		 430 aa  593  1e-168  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0146  ATP-dependent RNA helicase RhlB  65.81 
 
 		 434 aa  590  1e-167  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00149472  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.51 
 
 		 421 aa  590  1e-167  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.74 
 
 		 421 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0509  ATP-dependent RNA helicase RhlB  65.66 
 
 		 423 aa  585  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  65.65 
 
 		 421 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.27 
 
 		 418 aa  583  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  66.04 
 
 		 421 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  62.44 
 
 		 428 aa  557  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  68.03 
 
 		 429 aa  550  1e-155  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0356  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.66 
 
 		 432 aa  470  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.74 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03716  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56 
 
 		 574 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3674  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.14 
 
 		 574 aa  439  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2156  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.63 
 
 		 544 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.74 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2070  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.88 
 
 		 438 aa  429  1e-119  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.181762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2245  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.88 
 
 		 544 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2582  DEAD/DEAH box helicase-like  56.2 
 
 		 431 aa  423  1e-117  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.24 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000426275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.36 
 
 		 451 aa  392  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.28 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.19 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0735  DEAD helicase family protein  46.46 
 
 		 433 aa  382  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2779  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.56 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000517174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.38 
 
 		 452 aa  381  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3035  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.43 
 
 		 438 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000379043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.42 
 
 		 423 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.48 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0620  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.11 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.651173 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1623  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.44 
 
 		 424 aa  342  1e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.66 
 
 		 483 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.36 
 
 		 521 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.54 
 
 		 383 aa  340  4e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000481841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3565  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.81 
 
 		 482 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.36909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.15 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.15 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.15 
 
 		 489 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.53 
 
 		 507 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.53 
 
 		 529 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0943  putative ATP-dependent RNA helicase  46.42 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1474  DEAD/DEAH box helicase-like  46.42 
 
 		 384 aa  335  1e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.738757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.44 
 
 		 492 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1070  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.09 
 
 		 483 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.09 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.85 
 
 		 464 aa  323  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2119  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.74 
 
 		 452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.637401  hitchhiker  0.000114297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  38.15 
 
 		 506 aa  302  8.000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3252  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.04 
 
 		 504 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0717985  normal  0.458029 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1132  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.43 
 
 		 484 aa  298  1e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1516  DEAD/DEAH box helicase-like  41.02 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1053  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.64 
 
 		 484 aa  296  6e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  43.18 
 
 		 527 aa  295  8e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.9 
 
 		 487 aa  292  7e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0617  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.21 
 
 		 479 aa  290  3e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.028654 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3200  dystroglycan-type cadherin-like  38.98 
 
 		 516 aa  290  4e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2155  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.8 
 
 		 504 aa  290  4e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.659506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3878  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.91 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1252  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.77 
 
 		 479 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.225431  normal  0.30978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.5 
 
 		 443 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2476  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.84 
 
 		 461 aa  286  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.753535  normal  0.196706 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1257  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.51 
 
 		 460 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.41988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>