More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2467 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
440 aa  892    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0356  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  67.3 
 
 
432 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2070  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.95 
 
 
438 aa  484  1e-135  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.181762 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0461  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.42 
 
 
434 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.388345  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00338  ATP-dependent RNA helicase RhlB  58.65 
 
 
437 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002096  ATP-dependent RNA helicase RhlB  58.23 
 
 
439 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3674  ATP-dependent RNA helicase RhlB  59.9 
 
 
574 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2697  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.67 
 
 
438 aa  465  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0399  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.73 
 
 
436 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  57.38 
 
 
421 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.38 
 
 
421 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.38 
 
 
421 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.38 
 
 
421 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.38 
 
 
421 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0449  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.34 
 
 
432 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  57.38 
 
 
421 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.88 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.77 
 
 
421 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.14 
 
 
421 aa  460  9.999999999999999e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.77 
 
 
421 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  61.2 
 
 
429 aa  460  9.999999999999999e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4069  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.93 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.341266 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.77 
 
 
421 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.38 
 
 
421 aa  461  9.999999999999999e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.77 
 
 
421 aa  460  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3432  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.53 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3951  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.93 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3928  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.93 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.38 
 
 
421 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3876  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.93 
 
 
438 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.587664  hitchhiker  0.000145647 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.17 
 
 
430 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.7 
 
 
451 aa  455  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0202  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.32 
 
 
428 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4303  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.52 
 
 
421 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0431153  normal  0.722207 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.83 
 
 
421 aa  457  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03716  ATP-dependent RNA helicase RhlB  59.5 
 
 
574 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.85 
 
 
428 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2582  DEAD/DEAH box helicase-like  61.74 
 
 
431 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0514  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.28 
 
 
441 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0317755 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.36 
 
 
490 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0411  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.2 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3614  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.2 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0410  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.61 
 
 
439 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  58.07 
 
 
428 aa  451  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0407  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.51 
 
 
439 aa  449  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0339  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.31 
 
 
435 aa  450  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.181774  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4109  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.08 
 
 
435 aa  449  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297113  hitchhiker  0.000114369 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0146  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.46 
 
 
434 aa  449  1e-125  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00149472  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4205  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.58 
 
 
430 aa  448  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2779  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.29 
 
 
482 aa  451  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000517174  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.14 
 
 
421 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.61 
 
 
428 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3215  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.74 
 
 
439 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4036  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.18 
 
 
428 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.269062  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2245  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.65 
 
 
544 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2156  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.5 
 
 
544 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0178  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.18 
 
 
428 aa  441  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  54.55 
 
 
419 aa  444  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0509  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.18 
 
 
423 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.26 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.92 
 
 
443 aa  432  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.14 
 
 
475 aa  432  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000426275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.81 
 
 
452 aa  428  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3035  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.15 
 
 
438 aa  425  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000379043  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0735  DEAD helicase family protein  55.11 
 
 
433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.1 
 
 
423 aa  354  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.37 
 
 
533 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.75 
 
 
492 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.65 
 
 
529 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.65 
 
 
507 aa  335  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1623  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.99 
 
 
424 aa  333  3e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.15 
 
 
489 aa  333  4e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.15 
 
 
480 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.15 
 
 
480 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.5 
 
 
521 aa  332  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3565  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.41 
 
 
482 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.41 
 
 
483 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1070  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.61 
 
 
483 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0620  ATP-dependent RNA helicase RhlB  45.84 
 
 
392 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651173 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.45 
 
 
397 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.53 
 
 
464 aa  324  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.5 
 
 
489 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1474  DEAD/DEAH box helicase-like  44.59 
 
 
384 aa  299  5e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.738757  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0943  putative ATP-dependent RNA helicase  44.33 
 
 
396 aa  298  1e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.54 
 
 
403 aa  296  3e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000744604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3295  putative ATP-dependent RNA helicase 2  41.94 
 
 
491 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.53 
 
 
383 aa  295  9e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000481841  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3362  ATP-dependent RNA helicase  42.23 
 
 
484 aa  292  7e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2001  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.8 
 
 
514 aa  291  1e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0167205  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1526  superfamily II DNA/RNA helicase  41.08 
 
 
527 aa  291  1e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1040  DEAD/DEAH box helicase  42.97 
 
 
482 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.33431  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1917  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.97 
 
 
482 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0135106  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0828  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.97 
 
 
482 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00138839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1201  DEAD/DEAH box helicase  42.97 
 
 
482 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0323  DEAD/DEAH box helicase  42.97 
 
 
482 aa  291  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0723689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1352  putative ATP-dependent RNA helicase 2  42.97 
 
 
559 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.051549  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1193  DEAD/DEAH box helicase  42.97 
 
 
481 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.444937  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0981  ATP-dependent RNA helicase RhlE  42.86 
 
 
571 aa  290  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2570  ATP-dependent RNA helicase  40.19 
 
 
446 aa  290  4e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.463423 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0396  superfamily II DNA/RNA helicase  41.48 
 
 
551 aa  290  4e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>