More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2070 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2070  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
438 aa  899    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.514873  normal  0.181762 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2015  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  66.08 
 
 
430 aa  553  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0356  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.43 
 
 
432 aa  505  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.54 
 
 
440 aa  481  1e-135  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03716  ATP-dependent RNA helicase RhlB  58.93 
 
 
574 aa  464  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3674  ATP-dependent RNA helicase RhlB  57.89 
 
 
574 aa  464  1e-129  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2697  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.95 
 
 
438 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.578293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2582  DEAD/DEAH box helicase-like  59.52 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002096  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.81 
 
 
439 aa  461  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895445  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2245  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.64 
 
 
544 aa  460  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.298458  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2156  ATP-dependent RNA helicase RhlB  56.64 
 
 
544 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00338  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.29 
 
 
437 aa  453  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1442  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.18 
 
 
490 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4109  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.15 
 
 
435 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0297113  hitchhiker  0.000114369 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2779  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.13 
 
 
482 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000517174  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.75 
 
 
419 aa  442  1e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0339  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.55 
 
 
435 aa  441  1e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.181774  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0514  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.49 
 
 
441 aa  443  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0317755 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3876  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.4 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.587664  hitchhiker  0.000145647 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4069  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.4 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.341266 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0945  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.88 
 
 
451 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000594759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3951  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.4 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0411  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.93 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0146  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.94 
 
 
434 aa  439  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00149472  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3928  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.4 
 
 
438 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3614  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.93 
 
 
439 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0461  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.94 
 
 
434 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.388345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0399  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.92 
 
 
436 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3432  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.93 
 
 
439 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.83 
 
 
421 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.83 
 
 
421 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4195  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.83 
 
 
421 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3191  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.85 
 
 
418 aa  436  1e-121  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00108061 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4126  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.83 
 
 
421 aa  435  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0410  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.47 
 
 
439 aa  435  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0407  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.23 
 
 
439 aa  434  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0449  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.47 
 
 
432 aa  434  1e-120  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4303  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.59 
 
 
421 aa  431  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0431153  normal  0.722207 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0178  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.52 
 
 
428 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4036  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.52 
 
 
428 aa  429  1e-119  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.269062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4005  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.12 
 
 
421 aa  431  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00596063 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03658  ATP-dependent RNA helicase  51.65 
 
 
421 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000314324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4197  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.65 
 
 
421 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00222167  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0522  ATP-dependent RNA helicase RhlB  52.21 
 
 
443 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.00923533  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.65 
 
 
421 aa  426  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0174  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.42 
 
 
428 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4223  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.65 
 
 
421 aa  426  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0291518  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4144  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.65 
 
 
421 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0155  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.99 
 
 
428 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3215  ATP-dependent RNA helicase RhlB  49.88 
 
 
439 aa  425  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.479861  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03607  hypothetical protein  51.65 
 
 
421 aa  426  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000127308  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4141  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.65 
 
 
421 aa  425  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5213  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.65 
 
 
421 aa  425  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3996  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.65 
 
 
421 aa  426  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0202  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.52 
 
 
428 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0509  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.42 
 
 
423 aa  423  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3035  ATP-dependent RNA helicase RhlB  53.68 
 
 
438 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000379043  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00568  ATP-dependent RNA helicase RhlB  55.82 
 
 
429 aa  424  1e-117  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.595668  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0158  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.4 
 
 
428 aa  424  1e-117  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.495687 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.66 
 
 
421 aa  424  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4205  ATP-dependent RNA helicase RhlB  50.59 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0735  DEAD helicase family protein  52.74 
 
 
433 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2278  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.54 
 
 
452 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.64228  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4013  ATP-dependent RNA helicase RhlB  51.05 
 
 
430 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1374  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.02 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000426275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1776  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.43 
 
 
423 aa  366  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0054  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.61 
 
 
464 aa  360  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.536242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2643  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.61 
 
 
533 aa  360  3e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11290  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.81 
 
 
521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1244  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.31 
 
 
529 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1623  DEAD/DEAH box helicase-like protein  47.61 
 
 
424 aa  348  1e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.216615  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14040  ATP-dependent RNA helicase RhlB  47.31 
 
 
507 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  0.0213445 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3565  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.55 
 
 
482 aa  347  3e-94  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.36909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1295  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.04 
 
 
480 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.587657  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4554  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.04 
 
 
489 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4430  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.04 
 
 
480 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.649102 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0902  ATP-dependent RNA helicase RhlB  46.04 
 
 
483 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.169794  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0971  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.72 
 
 
492 aa  332  6e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.951762  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1253  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.91 
 
 
397 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1070  ATP-dependent RNA helicase RhlB  44.79 
 
 
483 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1565  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.54 
 
 
492 aa  326  6e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0620  ATP-dependent RNA helicase RhlB  43.08 
 
 
392 aa  326  6e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.651173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1474  DEAD/DEAH box helicase-like  45.74 
 
 
384 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.738757  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0943  putative ATP-dependent RNA helicase  45.52 
 
 
396 aa  324  2e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3311  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.19 
 
 
515 aa  322  8e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.23551  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0648  putative ATP-dependent RNA helicase 1  42.42 
 
 
543 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.498001 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0426  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  42.38 
 
 
522 aa  315  9e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.234124  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1342  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.97 
 
 
426 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0933  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.2 
 
 
479 aa  313  3.9999999999999997e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461598  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1947  DEAD/DEAH box helicase-like protein  42.35 
 
 
459 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.673176  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3851  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.72 
 
 
513 aa  312  5.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282331 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0544  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.1 
 
 
418 aa  311  1e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0817  DEAD/DEAH box helicase-like protein  41.86 
 
 
452 aa  310  4e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.187281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1952  DEAD/DEAH box helicase-like  39.76 
 
 
426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.62212 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0770  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.83 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000481841  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2153  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.86 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0826184  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3825  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.64 
 
 
443 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0420  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.57 
 
 
560 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437867  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0434  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.57 
 
 
565 aa  306  5.0000000000000004e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326828  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0539  ATP-dependent RNA helicase protein  41.77 
 
 
540 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00876522  normal  0.882809 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>