More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_2002 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 296 aa  579  1e-164  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1715  protoheme IX farnesyltransferase  57.78 
 
 		 285 aa  291  9e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 		 289 aa  172  7.999999999999999e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  36.65 
 
 		 478 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 		 622 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  37.19 
 
 		 483 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  37.8 
 
 		 472 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  36.26 
 
 		 326 aa  155  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  35.4 
 
 		 328 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  35.36 
 
 		 317 aa  155  1e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  36.82 
 
 		 278 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  35.13 
 
 		 535 aa  152  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  37.01 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 		 308 aa  150  3e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  36.73 
 
 		 279 aa  149  6e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  35.88 
 
 		 321 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  36.56 
 
 		 299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 		 534 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  35.07 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 304 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  36.07 
 
 		 323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  37.06 
 
 		 482 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 323 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  37.77 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 		 313 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 		 302 aa  145  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  36.65 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1931  protoheme IX farnesyltransferase  37.23 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  35.58 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  35.1 
 
 		 313 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  35.97 
 
 		 286 aa  143  3e-33  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1636  protoheme IX farnesyltransferase  36.79 
 
 		 297 aa  143  4e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.156009  normal  0.433074 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 		 495 aa  143  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  34.64 
 
 		 328 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  35.74 
 
 		 294 aa  142  6e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  35.28 
 
 		 316 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  37.77 
 
 		 308 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  36.46 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  35.52 
 
 		 312 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  35.52 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  35.38 
 
 		 296 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 		 325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  35.89 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  36.4 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 		 298 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  35.69 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0270  protoheme IX farnesyltransferase  34.3 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.80654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  34.6 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  34.35 
 
 		 324 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  35.76 
 
 		 307 aa  139  6e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  139  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  33.89 
 
 		 306 aa  139  7e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0323  protoheme IX farnesyltransferase  34.66 
 
 		 311 aa  139  7.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  34.01 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  33.79 
 
 		 341 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  34.6 
 
 		 289 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.23 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 300 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04005  protoheme IX farnesyltransferase  34.73 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 295 aa  137  2e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  32.63 
 
 		 300 aa  137  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  32.45 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  33.66 
 
 		 315 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  35.79 
 
 		 323 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  32.75 
 
 		 312 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  33.66 
 
 		 312 aa  136  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  36.2 
 
 		 452 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 313 aa  136  4e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 317 aa  136  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  36.9 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  33.94 
 
 		 305 aa  135  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  35.62 
 
 		 296 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  36.16 
 
 		 317 aa  135  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  35.88 
 
 		 313 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  35.63 
 
 		 307 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0435  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.605923  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 279 aa  134  9.999999999999999e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  36.64 
 
 		 305 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  36.13 
 
 		 299 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0682  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.392263  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0499  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 		 309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0517  protoheme IX farnesyltransferase  32.99 
 
 		 300 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  35.86 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>