More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0096 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  66.08 
 
 
317 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1588  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 
309 aa  189  4e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  37.85 
 
 
622 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  37.95 
 
 
317 aa  169  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  39.86 
 
 
289 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 
534 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  40.34 
 
 
313 aa  169  7e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  42.62 
 
 
313 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  41.47 
 
 
317 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 
328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 
313 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  38.44 
 
 
306 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  39.44 
 
 
535 aa  164  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 
289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  39.37 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  36.64 
 
 
312 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.88 
 
 
296 aa  160  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
304 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 
304 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  37.97 
 
 
307 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 
317 aa  159  6e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  37.63 
 
 
294 aa  158  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  38.28 
 
 
624 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 
321 aa  155  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  38.87 
 
 
302 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  35.74 
 
 
323 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  34.71 
 
 
315 aa  155  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  36.68 
 
 
326 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  35.74 
 
 
323 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  36.68 
 
 
308 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  35.31 
 
 
316 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  38.16 
 
 
315 aa  152  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  37.24 
 
 
308 aa  152  8e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  32.87 
 
 
318 aa  152  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  35.22 
 
 
316 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  38.81 
 
 
302 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  36.24 
 
 
318 aa  150  3e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 
309 aa  150  3e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  40.34 
 
 
339 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  37.32 
 
 
328 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  33.96 
 
 
305 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 
309 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  37.3 
 
 
314 aa  149  7e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 
304 aa  149  8e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  36.08 
 
 
312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  35.25 
 
 
299 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  35.66 
 
 
326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  34.84 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  37.02 
 
 
294 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  38.68 
 
 
297 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 
323 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 
342 aa  146  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  36.07 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  37.07 
 
 
312 aa  145  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  36.17 
 
 
303 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  37.11 
 
 
328 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  37.11 
 
 
328 aa  145  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 
443 aa  145  6e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  38.64 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  33.69 
 
 
301 aa  145  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  36.9 
 
 
353 aa  145  9e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  37.24 
 
 
341 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  38.46 
 
 
317 aa  145  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  36.45 
 
 
317 aa  145  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  34.84 
 
 
335 aa  144  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  34.65 
 
 
316 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  36.12 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  34.34 
 
 
301 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  35.28 
 
 
310 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  35.49 
 
 
304 aa  142  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 
312 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  31.43 
 
 
303 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00940  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.110139  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  39.13 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0125  protoheme IX farnesyltransferase  37.91 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350123  normal  0.0256302 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  32.83 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2001  protoheme IX farnesyltransferase  36.99 
 
 
325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0149749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 
317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 
299 aa  140  3e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 
278 aa  140  3e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  35.68 
 
 
301 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 
324 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  35.47 
 
 
319 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
321 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  34.96 
 
 
304 aa  139  4.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 
325 aa  139  6e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  34.86 
 
 
296 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  32.88 
 
 
302 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 
306 aa  139  7.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0127  protoheme IX farnesyltransferase  37.64 
 
 
297 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
300 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
300 aa  138  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  36.01 
 
 
315 aa  138  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
300 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>