More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1811 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 
278 aa  533  1e-151  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  88.49 
 
 
278 aa  483  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0590  protoheme IX farnesyltransferase  74.64 
 
 
292 aa  344  1e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358239  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  63.04 
 
 
279 aa  332  5e-90  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  68.71 
 
 
279 aa  328  4e-89  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  50.18 
 
 
286 aa  272  5.000000000000001e-72  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
289 aa  158  1e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  37.74 
 
 
296 aa  146  3e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
307 aa  142  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  34.74 
 
 
483 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 
325 aa  138  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 
302 aa  137  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 
317 aa  137  2e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
316 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  46.11 
 
 
315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  41.92 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  34.01 
 
 
622 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  35.61 
 
 
299 aa  135  8e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  39.8 
 
 
315 aa  135  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  39.39 
 
 
315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  39.39 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  40.41 
 
 
321 aa  133  3e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  43.92 
 
 
302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 
315 aa  132  5e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  42.05 
 
 
326 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  39.55 
 
 
306 aa  132  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  43.08 
 
 
310 aa  132  6.999999999999999e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  40.5 
 
 
318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  34.36 
 
 
535 aa  131  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  39.13 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  39.13 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  35.42 
 
 
305 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  39.13 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 
316 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 
308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  43.08 
 
 
289 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  37.28 
 
 
326 aa  130  3e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  42.71 
 
 
309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  39.58 
 
 
299 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  40.69 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  38.21 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  38.86 
 
 
316 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  40.93 
 
 
304 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 
304 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  37.75 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  40.78 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  37.75 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  37.2 
 
 
317 aa  126  3e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 
310 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 
310 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  40.72 
 
 
313 aa  126  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  37.69 
 
 
328 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  38.64 
 
 
294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 
472 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  38.08 
 
 
315 aa  126  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  37.88 
 
 
317 aa  126  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  37.38 
 
 
318 aa  126  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
311 aa  125  6e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
317 aa  125  7e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
317 aa  125  7e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  37.56 
 
 
312 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  37.76 
 
 
317 aa  125  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  40.5 
 
 
313 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  39.3 
 
 
321 aa  125  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  36.92 
 
 
302 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  39.49 
 
 
312 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  37.13 
 
 
534 aa  124  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  32.16 
 
 
295 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  38.78 
 
 
339 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  35.26 
 
 
295 aa  124  2e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  40.91 
 
 
302 aa  124  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 
317 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  39.3 
 
 
307 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 
317 aa  123  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 
313 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 
328 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  41.03 
 
 
328 aa  123  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  38.97 
 
 
308 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  38.57 
 
 
304 aa  122  5e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  38.83 
 
 
317 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  40.93 
 
 
313 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1715  protoheme IX farnesyltransferase  42.11 
 
 
285 aa  122  6e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  40.51 
 
 
312 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  40.51 
 
 
353 aa  122  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  31.58 
 
 
341 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  36.73 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  36.98 
 
 
317 aa  121  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 
309 aa  121  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  36.1 
 
 
342 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  32.73 
 
 
495 aa  120  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  37.61 
 
 
296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 
443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  37.71 
 
 
317 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  38.66 
 
 
305 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  39.58 
 
 
306 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  42.19 
 
 
328 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  35.12 
 
 
317 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  32.65 
 
 
478 aa  119  6e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  36.98 
 
 
303 aa  119  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>