More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1923 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 279 aa  533  1e-150  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  67.63 
 
 		 278 aa  381  1e-105  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  68.71 
 
 		 278 aa  372  1e-102  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0590  protoheme IX farnesyltransferase  68.48 
 
 		 292 aa  331  9e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  61.87 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  47.86 
 
 		 286 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  38.36 
 
 		 289 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  41.46 
 
 		 622 aa  150  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  42.5 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  41.41 
 
 		 321 aa  149  6e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  42.44 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  36.2 
 
 		 483 aa  144  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  40.91 
 
 		 315 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 		 316 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.18 
 
 		 302 aa  142  5e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  37.69 
 
 		 321 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  38.34 
 
 		 309 aa  142  7e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  37.79 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  36.76 
 
 		 296 aa  142  9e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  39.9 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  39.9 
 
 		 312 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  38.6 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  36.84 
 
 		 534 aa  139  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  43.15 
 
 		 317 aa  139  7e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  39.02 
 
 		 317 aa  138  7.999999999999999e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  37.86 
 
 		 299 aa  137  2e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  40.1 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  35.74 
 
 		 472 aa  135  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  37.55 
 
 		 307 aa  135  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1715  protoheme IX farnesyltransferase  37.34 
 
 		 285 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  36.61 
 
 		 335 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  38.79 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  38.79 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  39.23 
 
 		 310 aa  133  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  39.07 
 
 		 535 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  38 
 
 		 318 aa  132  5e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 		 294 aa  132  5e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  42.5 
 
 		 309 aa  132  6e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  37.12 
 
 		 317 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  40.1 
 
 		 345 aa  132  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  39.42 
 
 		 317 aa  132  9e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  36.63 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  40.5 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  36.95 
 
 		 339 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  38.33 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  37.2 
 
 		 341 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  41.43 
 
 		 306 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  41 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  37.06 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1181  protoheme IX farnesyltransferase  36.17 
 
 		 482 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  38.24 
 
 		 317 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  39.39 
 
 		 324 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  40.4 
 
 		 316 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  39.21 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  39.6 
 
 		 328 aa  129  6e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 295 aa  128  9.000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 		 328 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  38.14 
 
 		 328 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 313 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  37.56 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  37.56 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  40.3 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  40.1 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 		 312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  38.25 
 
 		 353 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  36.28 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  30.22 
 
 		 295 aa  126  3e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  39.9 
 
 		 342 aa  127  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  39.71 
 
 		 311 aa  126  3e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  40.59 
 
 		 289 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  37.59 
 
 		 319 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2302  protoheme IX farnesyltransferase  35.13 
 
 		 495 aa  127  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  34.71 
 
 		 478 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  39.5 
 
 		 312 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2407  protoheme IX farnesyltransferase  41.5 
 
 		 452 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.805442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  36.59 
 
 		 318 aa  125  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1711  protoheme IX farnesyltransferase  39.61 
 
 		 297 aa  125  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  40.61 
 
 		 313 aa  125  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  36.77 
 
 		 323 aa  125  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  36.92 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  38.5 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  34.97 
 
 		 293 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  36.28 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  34.01 
 
 		 295 aa  124  1e-27  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  37.37 
 
 		 299 aa  124  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 		 333 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  37.67 
 
 		 328 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 		 333 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  39.81 
 
 		 310 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  36.49 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  38.5 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  39.7 
 
 		 326 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  38.5 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  36.56 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>