More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0590 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_0590  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 292 aa  568  1e-161  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  73.55 
 
 		 278 aa  404  1e-111  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  74.64 
 
 		 278 aa  395  1e-109  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1946  protoheme IX farnesyltransferase  62.32 
 
 		 279 aa  324  9e-88  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  68.48 
 
 		 279 aa  318  6e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  52.88 
 
 		 286 aa  281  9e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  35.47 
 
 		 296 aa  145  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  39.19 
 
 		 622 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  35.8 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  33.1 
 
 		 289 aa  144  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  39.33 
 
 		 315 aa  142  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  36.8 
 
 		 316 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  37.27 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  39.11 
 
 		 315 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  38.86 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1839  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 319 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000154836 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  37.66 
 
 		 318 aa  136  5e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  37.61 
 
 		 312 aa  135  6.0000000000000005e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  37.26 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 		 315 aa  135  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.31 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  37.05 
 
 		 317 aa  135  8e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  36.95 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 328 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2852  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 		 483 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  37.33 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  37.61 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  37.19 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  38.81 
 
 		 325 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 		 317 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  37.02 
 
 		 310 aa  134  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2098  protoheme IX farnesyltransferase  40 
 
 		 315 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.562695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  37.44 
 
 		 317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2375  protoheme IX farnesyltransferase  39.9 
 
 		 335 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1715  protoheme IX farnesyltransferase  40.3 
 
 		 285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  41.87 
 
 		 317 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  36.55 
 
 		 311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  37.55 
 
 		 317 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11440  protoheme IX farnesyltransferase  40.82 
 
 		 326 aa  130  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0124066  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  35.8 
 
 		 317 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  38.29 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  38.29 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  38.29 
 
 		 333 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  39.83 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  36.14 
 
 		 341 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 309 aa  129  5.0000000000000004e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2521  protoheme IX farnesyltransferase  38.05 
 
 		 328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.352077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  35.74 
 
 		 308 aa  129  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06264  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 		 304 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 		 472 aa  128  9.000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  35.63 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  33.2 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  33.89 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  39.42 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  39.42 
 
 		 328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  33.2 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  37.16 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  37.34 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  37.13 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  40.91 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  39.09 
 
 		 308 aa  126  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  37.88 
 
 		 326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  40.93 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  37.2 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  39.52 
 
 		 316 aa  125  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  40.76 
 
 		 345 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  36.57 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  38.31 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 		 312 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  38.94 
 
 		 353 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  40.76 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1265  protoheme IX farnesyltransferase  37.09 
 
 		 332 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  38.89 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  33.8 
 
 		 535 aa  124  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 		 313 aa  123  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  37.98 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  38.42 
 
 		 330 aa  123  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  41.71 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  37.56 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 299 aa  122  5e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  37.56 
 
 		 310 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  40.35 
 
 		 296 aa  122  7e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  39.34 
 
 		 328 aa  122  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  37.62 
 
 		 342 aa  122  9e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  36.36 
 
 		 302 aa  121  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  37 
 
 		 294 aa  121  9.999999999999999e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  37.62 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  36.62 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  40.51 
 
 		 289 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  37.38 
 
 		 313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1689  protoheme IX farnesyltransferase  39.32 
 
 		 298 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.575941  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  37.21 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  39.9 
 
 		 304 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2921  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2487  protoheme IX farnesyltransferase  36.54 
 
 		 478 aa  120  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.316472  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  32.38 
 
 		 295 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>