More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1225 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 289 aa  577  1e-164  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  42.61 
 
 		 534 aa  202  4e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2002  protoheme IX farnesyltransferase  37.92 
 
 		 296 aa  193  4e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  41.75 
 
 		 535 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  37.23 
 
 		 317 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  36.52 
 
 		 622 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  36.97 
 
 		 323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  36.62 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  37.94 
 
 		 323 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  38.66 
 
 		 305 aa  179  4.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  39.15 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  36.52 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  36.88 
 
 		 318 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  36.93 
 
 		 304 aa  175  9e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  36.88 
 
 		 324 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  35.82 
 
 		 317 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  39.52 
 
 		 309 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 		 317 aa  170  3e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 299 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  34.36 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  36.52 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  35.19 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  44.88 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  34.29 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2423  protoheme IX farnesyltransferase  36.01 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.516292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  38.91 
 
 		 345 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  37.46 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  36.71 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  34.72 
 
 		 306 aa  166  4e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15280  protoheme IX farnesyltransferase  38.06 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0625707  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  34.6 
 
 		 328 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0310  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 278 aa  165  6.9999999999999995e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.467497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1811  protoheme IX farnesyltransferase  34.78 
 
 		 278 aa  165  9e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.632186  normal  0.509325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 		 443 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  36.27 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1715  protoheme IX farnesyltransferase  36.19 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  38.29 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  35.09 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  35.69 
 
 		 298 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  34.74 
 
 		 304 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 307 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  39.38 
 
 		 318 aa  161  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  34.83 
 
 		 313 aa  161  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  33.45 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  36.3 
 
 		 289 aa  160  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  34.39 
 
 		 302 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  31.93 
 
 		 301 aa  159  6e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  32.07 
 
 		 326 aa  159  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1933  protoheme IX farnesyltransferase  36.27 
 
 		 342 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19930  protoheme IX farnesyltransferase  37.54 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.440013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  34.72 
 
 		 313 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  38.98 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  43.98 
 
 		 313 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2542  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.988716  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 		 317 aa  156  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  40.99 
 
 		 295 aa  156  4e-37  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  35.29 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  35.46 
 
 		 297 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  35.99 
 
 		 316 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  41.78 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  34.62 
 
 		 472 aa  155  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  34.14 
 
 		 312 aa  156  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  40.76 
 
 		 308 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  43 
 
 		 321 aa  155  7e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1588  protoheme IX farnesyltransferase  33.56 
 
 		 309 aa  155  9e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  35.64 
 
 		 316 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  37.21 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  38.38 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  34.51 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  34.27 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  38.65 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2973  protoheme IX farnesyltransferase  34.38 
 
 		 321 aa  153  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  34.51 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  35.23 
 
 		 295 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  31.14 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  36.53 
 
 		 300 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  38.03 
 
 		 313 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  32.86 
 
 		 299 aa  152  5.9999999999999996e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6167  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  35.58 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  41.23 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  35.58 
 
 		 310 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2894  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 300 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  37.44 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  39.1 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2848  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.273412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2224  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2402  protoheme IX farnesyltransferase  34.15 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2837  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 300 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1923  protoheme IX farnesyltransferase  37.37 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0229  protoheme IX farnesyltransferase  36.49 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00331639  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  34.51 
 
 		 315 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  35.74 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  32.98 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  36.74 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1046  protoheme IX farnesyltransferase  32.35 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  31.51 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  38.36 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>