More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1588 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1588  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 309 aa  623  1e-177  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0096  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 299 aa  172  6.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2102  protoheme IX farnesyltransferase  39.19 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0306599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  35.81 
 
 		 323 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  33.75 
 
 		 316 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  34.07 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  34.82 
 
 		 309 aa  149  7e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  32.79 
 
 		 622 aa  149  7e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  36.33 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  32.9 
 
 		 325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  34.46 
 
 		 317 aa  146  5e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  33.55 
 
 		 316 aa  144  3e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  35.02 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  33.99 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  37.01 
 
 		 302 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  33.44 
 
 		 305 aa  141  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  34.54 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0526  protoheme IX farnesyltransferase  33.44 
 
 		 318 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  32.67 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  30.91 
 
 		 313 aa  139  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  34 
 
 		 328 aa  139  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  36 
 
 		 295 aa  139  6e-32  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  33.23 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  33.23 
 
 		 310 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0520  protoheme IX farnesyltransferase  30.95 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.62584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0250  protoheme IX farnesyltransferase  33.44 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0627  protoheme IX farnesyltransferase  33.78 
 
 		 624 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.234547 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  33.78 
 
 		 308 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 		 534 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  31.7 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1225  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 289 aa  135  9.999999999999999e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  32.28 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  33.77 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0408  protoheme IX farnesyltransferase  34.84 
 
 		 312 aa  134  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  33.77 
 
 		 304 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  36.86 
 
 		 310 aa  133  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 333 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  36.42 
 
 		 333 aa  132  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  33.21 
 
 		 443 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3315  protoheme IX farnesyltransferase  35.58 
 
 		 317 aa  132  7.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000327669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11479  protoheme IX farnesyltransferase  35.16 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.0489299999999998e-105  normal  0.920568 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  31.67 
 
 		 316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  30.41 
 
 		 321 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5185  protoheme IX farnesyltransferase  35.53 
 
 		 307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.264459  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  32.06 
 
 		 310 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  33.47 
 
 		 310 aa  129  7.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 301 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  32.89 
 
 		 535 aa  129  9.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  31.75 
 
 		 330 aa  129  9.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  30.77 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  30.92 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0170  protoheme IX farnesyltransferase  31.39 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15990  protoheme IX farnesyltransferase  33.97 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.37638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  31.33 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1558  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 		 304 aa  127  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14299  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  30.92 
 
 		 312 aa  127  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0708  protoheme IX farnesyltransferase  36.04 
 
 		 296 aa  127  3e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  34.3 
 
 		 345 aa  127  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2798  protoheme IX farnesyltransferase  32.7 
 
 		 472 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  31.23 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1649  protoheme IX farnesyltransferase  37.89 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2263  protoheme IX farnesyltransferase  35.71 
 
 		 317 aa  126  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000348066  normal  0.0917465 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2060  protoheme IX farnesyltransferase  33.02 
 
 		 306 aa  126  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2075  protoheme IX farnesyltransferase  37.5 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0259319  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  34.89 
 
 		 300 aa  125  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  33.22 
 
 		 296 aa  125  9e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2600  protoheme IX farnesyltransferase  41.82 
 
 		 276 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.400593 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  32.18 
 
 		 305 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  33.9 
 
 		 317 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  30.5 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  32.24 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  30.62 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3088  protoheme IX farnesyltransferase  34.18 
 
 		 342 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.604618  normal  0.308497 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1979  protoheme IX farnesyltransferase  33 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.969251 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  33.23 
 
 		 328 aa  124  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2721  protoheme IX farnesyltransferase  34.81 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201425 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13220  protoheme IX farnesyltransferase  32.92 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.670624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  34.42 
 
 		 299 aa  124  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 295 aa  123  4e-27  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  30.59 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  32.78 
 
 		 315 aa  123  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  32.9 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  35 
 
 		 309 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 		 300 aa  122  6e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  33.67 
 
 		 298 aa  122  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4319  protoheme IX farnesyltransferase  32.79 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0147  protoheme IX farnesyltransferase  32.79 
 
 		 301 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  34.04 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4188  protoheme IX farnesyltransferase  32.79 
 
 		 301 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6012  protoheme IX farnesyltransferase  35.83 
 
 		 317 aa  122  9e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00798701  normal  0.725662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  32.11 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2160  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4120  protoheme IX farnesyltransferase  33.87 
 
 		 301 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0110  protoheme IX farnesyltransferase  29.53 
 
 		 297 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  32.11 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  33.33 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3691  protoheme IX farnesyltransferase  35.16 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.358596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>