77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1969 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  75.83 
 
 		 427 aa  643    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  863    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  46.21 
 
 		 443 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  46.05 
 
 		 452 aa  353  2e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  46.1 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  46.97 
 
 		 457 aa  346  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  45.65 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  45.65 
 
 		 476 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  44.3 
 
 		 441 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  33.41 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  31.74 
 
 		 523 aa  190  4e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  31.26 
 
 		 503 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  31.49 
 
 		 478 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  31.04 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  26.99 
 
 		 513 aa  119  9.999999999999999e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  27.05 
 
 		 525 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  25.79 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  27.07 
 
 		 517 aa  107  4e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  25.05 
 
 		 546 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  26.86 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  25.23 
 
 		 521 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  25.23 
 
 		 521 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  24.78 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  25.87 
 
 		 490 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  26.57 
 
 		 595 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  26.83 
 
 		 544 aa  86.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  27.07 
 
 		 421 aa  85.9  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  23.81 
 
 		 577 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  31.43 
 
 		 546 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  26.92 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  26.92 
 
 		 588 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  26.7 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  26.7 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  26.7 
 
 		 588 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  26.7 
 
 		 588 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  22.88 
 
 		 594 aa  73.6  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  22.46 
 
 		 591 aa  73.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  23.15 
 
 		 593 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  22.46 
 
 		 591 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  25.06 
 
 		 697 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  23.87 
 
 		 589 aa  71.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  22.74 
 
 		 595 aa  69.7  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  22.56 
 
 		 590 aa  69.3  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  23.67 
 
 		 505 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  24.07 
 
 		 533 aa  68.6  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  22.47 
 
 		 601 aa  68.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  26.13 
 
 		 560 aa  67.4  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  24.06 
 
 		 605 aa  67  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  24.89 
 
 		 587 aa  65.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  24.15 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  24.5 
 
 		 594 aa  62.4  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  29.38 
 
 		 477 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  30.56 
 
 		 477 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  22.85 
 
 		 602 aa  62  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  24.55 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  23.08 
 
 		 602 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  22.45 
 
 		 589 aa  59.3  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  22.66 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  22.66 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  22.75 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  26.15 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  22.04 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  22.04 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  24.04 
 
 		 585 aa  57  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  23.78 
 
 		 575 aa  57  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  22.6 
 
 		 583 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  23.77 
 
 		 589 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  24.32 
 
 		 590 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  24.1 
 
 		 615 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  23.29 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  22.07 
 
 		 570 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  26.47 
 
 		 601 aa  50.4  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  22.35 
 
 		 547 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  25.75 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  26.69 
 
 		 254 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  22.3 
 
 		 598 aa  44.3  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1625  prophage, terminase, ATPase subunit, putative  26.98 
 
 		 599 aa  43.5  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>