58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1462 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  870    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  33.41 
 
 		 505 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  31.88 
 
 		 418 aa  86.7  6e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  24.3 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1131  putative terminase B protein  29.32 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.815847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0324  putative terminase B protein  29.32 
 
 		 430 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  26.9 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  26.9 
 
 		 476 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  26.23 
 
 		 426 aa  72  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  25.71 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1030  hypothetical protein  36.77 
 
 		 402 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0399083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  26.76 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0037  Ppx/GppA family phosphatase  23.84 
 
 		 433 aa  66.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  27.37 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  26.39 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  21.78 
 
 		 525 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0794  hypothetical protein  22.7 
 
 		 509 aa  58.9  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  27.85 
 
 		 423 aa  57.8  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0366334 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0643  hypothetical protein  23.25 
 
 		 509 aa  55.1  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0169115 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  25.29 
 
 		 477 aa  54.3  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  24.11 
 
 		 477 aa  53.1  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  24.14 
 
 		 585 aa  52.8  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  22.13 
 
 		 525 aa  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  24.63 
 
 		 602 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  30.36 
 
 		 530 aa  50.1  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  26.02 
 
 		 461 aa  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  24.75 
 
 		 503 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  22.28 
 
 		 534 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  24.07 
 
 		 589 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  23.65 
 
 		 602 aa  49.7  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  25.68 
 
 		 533 aa  49.3  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  22.44 
 
 		 482 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  23.79 
 
 		 478 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  25 
 
 		 615 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  23.64 
 
 		 588 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  23.64 
 
 		 588 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  23.64 
 
 		 588 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  23.64 
 
 		 588 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  23.64 
 
 		 588 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  23.64 
 
 		 588 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6968  hypothetical protein  21.8 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  23.18 
 
 		 254 aa  47.4  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0357  hypothetical protein  27.08 
 
 		 441 aa  47  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3879  hypothetical protein  26.97 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591729  normal  0.0947318 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1890  hypothetical protein  23.9 
 
 		 534 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000136884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0339  hypothetical protein  31.4 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_300  hypothetical protein  31.4 
 
 		 457 aa  45.8  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1066  hypothetical protein  21.37 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08190  phage terminase-like protein, large subunit  25.12 
 
 		 546 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.038355  hitchhiker  0.000322264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  22.55 
 
 		 588 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  23.66 
 
 		 589 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  22.82 
 
 		 478 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  22.73 
 
 		 590 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  26.56 
 
 		 589 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  23.79 
 
 		 575 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  22.03 
 
 		 527 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  22.03 
 
 		 526 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  27.69 
 
 		 590 aa  43.1  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>