52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_2916 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  62.8 
 
 		 506 aa  681    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  66.15 
 
 		 588 aa  813    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  55.73 
 
 		 587 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  56.73 
 
 		 590 aa  704    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  66.15 
 
 		 588 aa  813    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  57.07 
 
 		 590 aa  709    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  59.76 
 
 		 588 aa  760    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1238    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  59.42 
 
 		 583 aa  742    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  66.15 
 
 		 588 aa  813    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  61.19 
 
 		 533 aa  676    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  58.06 
 
 		 589 aa  694    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  57.44 
 
 		 585 aa  709    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  56.76 
 
 		 589 aa  697    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  59.33 
 
 		 596 aa  725    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  65.64 
 
 		 588 aa  809    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  66.04 
 
 		 588 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  66.15 
 
 		 588 aa  813    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  58.26 
 
 		 594 aa  745    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  58.22 
 
 		 601 aa  740    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  61.81 
 
 		 589 aa  759    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  48.36 
 
 		 570 aa  556  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  44.99 
 
 		 682 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  44.99 
 
 		 682 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  46.67 
 
 		 575 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  43 
 
 		 602 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  42.16 
 
 		 605 aa  475  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  42.5 
 
 		 602 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  43.8 
 
 		 577 aa  473  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  42.26 
 
 		 593 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  43.1 
 
 		 590 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  39.93 
 
 		 595 aa  435  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  41.81 
 
 		 594 aa  434  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  40.55 
 
 		 601 aa  426  1e-118  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  40 
 
 		 599 aa  422  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  40 
 
 		 599 aa  421  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  40.1 
 
 		 615 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  39.15 
 
 		 591 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  39.51 
 
 		 591 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  37.91 
 
 		 598 aa  389  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  36.12 
 
 		 697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  62.99 
 
 		 254 aa  353  5e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  26.68 
 
 		 523 aa  123  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  31.2 
 
 		 241 aa  118  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  61.63 
 
 		 89 aa  116  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  26.52 
 
 		 427 aa  57.4  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  23.43 
 
 		 482 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  22.96 
 
 		 426 aa  51.6  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  24.07 
 
 		 421 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  20.71 
 
 		 452 aa  45.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  27.03 
 
 		 505 aa  44.7  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  20.14 
 
 		 478 aa  43.9  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>