42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1940 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  100 
 
 		 89 aa  181  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  67.05 
 
 		 588 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  65.91 
 
 		 583 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  62.92 
 
 		 596 aa  120  8e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  63.64 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  61.63 
 
 		 589 aa  116  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  60.92 
 
 		 585 aa  115  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  60.92 
 
 		 588 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  60.92 
 
 		 588 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  60.92 
 
 		 588 aa  114  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  60.92 
 
 		 588 aa  114  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  60.92 
 
 		 588 aa  114  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  60.92 
 
 		 588 aa  114  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  60.92 
 
 		 254 aa  114  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  56.32 
 
 		 601 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  53.41 
 
 		 587 aa  105  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  58.44 
 
 		 589 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  62.67 
 
 		 682 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  62.67 
 
 		 682 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  55.68 
 
 		 589 aa  98.2  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  57.3 
 
 		 590 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  57.3 
 
 		 590 aa  97.1  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  52.87 
 
 		 589 aa  91.3  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  50.67 
 
 		 594 aa  80.1  0.000000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  55.56 
 
 		 599 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  55.56 
 
 		 599 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  46.67 
 
 		 591 aa  77.4  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  46.67 
 
 		 591 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  41.67 
 
 		 598 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  42.35 
 
 		 570 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  52.78 
 
 		 602 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  45.33 
 
 		 594 aa  73.2  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  41.98 
 
 		 590 aa  72.8  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  51.39 
 
 		 615 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  43.21 
 
 		 605 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  45.33 
 
 		 595 aa  71.2  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  46.58 
 
 		 593 aa  70.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  48 
 
 		 601 aa  71.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  50 
 
 		 602 aa  70.5  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  44.59 
 
 		 577 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  41.67 
 
 		 697 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  41.67 
 
 		 575 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>