59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1282 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  54.52 
 
 
595 aa  667    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  65.05 
 
 
590 aa  773    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  61.41 
 
 
605 aa  788    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  92.52 
 
 
602 aa  1176    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  54.09 
 
 
594 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  64 
 
 
593 aa  793    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  54.41 
 
 
591 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  54.58 
 
 
591 aa  668    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  100 
 
 
602 aa  1260    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  51.25 
 
 
697 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  52.43 
 
 
682 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  52.43 
 
 
682 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  48.24 
 
 
577 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1472  hypothetical protein  45.9 
 
 
599 aa  504  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2767  hypothetical protein  45.9 
 
 
599 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.851255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  43.04 
 
 
589 aa  486  1e-136  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  43.79 
 
 
601 aa  485  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  44.92 
 
 
601 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  44.39 
 
 
596 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4835  hypothetical protein  43.93 
 
 
588 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.283168  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  44.73 
 
 
590 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  44.9 
 
 
590 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  45.55 
 
 
533 aa  462  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0239  protein of unknown function DUF264  43.31 
 
 
615 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.111761  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  43.32 
 
 
589 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  44.39 
 
 
589 aa  461  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  44.08 
 
 
588 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  44.68 
 
 
583 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  43.73 
 
 
588 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  43.9 
 
 
588 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  44.08 
 
 
588 aa  457  1e-127  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  43.9 
 
 
588 aa  456  1e-127  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  43.73 
 
 
588 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  43.19 
 
 
585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  42.64 
 
 
589 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  42.61 
 
 
594 aa  440  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  46.15 
 
 
587 aa  424  1e-117  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1939  terminase (ATPase subunit) related protein  43.31 
 
 
506 aa  383  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  36.88 
 
 
570 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3833  protein of unknown function DUF264  36.61 
 
 
575 aa  348  2e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  32.89 
 
 
598 aa  315  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  48 
 
 
254 aa  240  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  25.29 
 
 
523 aa  110  8.000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2326  hypothetical protein  30.59 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  25.33 
 
 
503 aa  75.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1940  terminase (ATPase subunit) related protein  52.78 
 
 
89 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.739724  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  24.94 
 
 
478 aa  73.9  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  24.89 
 
 
478 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  24.05 
 
 
457 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  23.91 
 
 
427 aa  58.2  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  21.21 
 
 
452 aa  58.2  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  23.5 
 
 
482 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  22.96 
 
 
443 aa  55.5  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  24.63 
 
 
421 aa  52.4  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  23.24 
 
 
441 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  22.48 
 
 
426 aa  48.9  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  21.81 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  21.81 
 
 
476 aa  45.8  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  20.57 
 
 
521 aa  44.7  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>