33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3416 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1068    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  32.9 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  33.41 
 
 		 426 aa  168  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  35.38 
 
 		 441 aa  157  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  34.32 
 
 		 443 aa  155  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  30.96 
 
 		 476 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  30.96 
 
 		 476 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  33.51 
 
 		 457 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  31.28 
 
 		 452 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  29.55 
 
 		 482 aa  128  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  27.65 
 
 		 523 aa  111  3e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  26.48 
 
 		 478 aa  90.1  9e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  26.85 
 
 		 503 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  26.59 
 
 		 478 aa  88.2  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  27.54 
 
 		 544 aa  76.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  24.59 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  25.74 
 
 		 513 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  25.42 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  25.42 
 
 		 546 aa  70.5  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  23.42 
 
 		 577 aa  67.4  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  25.24 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  26.44 
 
 		 517 aa  66.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  26.26 
 
 		 519 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  23.44 
 
 		 547 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  22.46 
 
 		 493 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  24.07 
 
 		 521 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  24.07 
 
 		 521 aa  50.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  20.47 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  24.62 
 
 		 560 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  22.65 
 
 		 682 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  22.65 
 
 		 682 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  20.57 
 
 		 602 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  22.71 
 
 		 490 aa  43.5  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>