27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2679 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  100 
 
 		 519 aa  1082    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  86.37 
 
 		 521 aa  907    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  86.37 
 
 		 521 aa  907    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  64.4 
 
 		 546 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  64.61 
 
 		 546 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  62.55 
 
 		 546 aa  595  1e-169  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  48 
 
 		 544 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  48.5 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  49.45 
 
 		 490 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  46.06 
 
 		 525 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  48.13 
 
 		 517 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  45.35 
 
 		 493 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  40.57 
 
 		 560 aa  348  1e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  40.37 
 
 		 547 aa  330  4e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  38.28 
 
 		 595 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  24.78 
 
 		 426 aa  96.7  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  23.67 
 
 		 427 aa  89  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  25.25 
 
 		 482 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  29.55 
 
 		 452 aa  87  7e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  29.15 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  31.33 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  31.33 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  23.37 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  21.69 
 
 		 523 aa  66.2  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  25.68 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  26.26 
 
 		 521 aa  59.7  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  24.35 
 
 		 596 aa  44.7  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>