26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2249 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  100 
 
 		 560 aa  1140    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  54.33 
 
 		 525 aa  546  1e-154  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  51.11 
 
 		 517 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  46.37 
 
 		 546 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  45.58 
 
 		 546 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  45.38 
 
 		 546 aa  414  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  42.38 
 
 		 513 aa  386  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  45.34 
 
 		 544 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  41.76 
 
 		 521 aa  356  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  41.76 
 
 		 521 aa  356  5e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  41.14 
 
 		 519 aa  347  4e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  41.77 
 
 		 493 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  38.98 
 
 		 490 aa  335  1e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  36.82 
 
 		 547 aa  296  8e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  33.6 
 
 		 595 aa  240  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  25.17 
 
 		 427 aa  94.4  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  26.8 
 
 		 476 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  26.8 
 
 		 476 aa  88.2  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  27.77 
 
 		 443 aa  87.4  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  25.6 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  25.86 
 
 		 452 aa  80.5  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  26.19 
 
 		 457 aa  76.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  24.95 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  26.13 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  24.62 
 
 		 521 aa  53.9  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  22.71 
 
 		 503 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>