57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3048 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  100 
 
 		 452 aa  934    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  78.26 
 
 		 441 aa  701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  77.41 
 
 		 457 aa  707    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  65.69 
 
 		 443 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  58.7 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  58.7 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  47.37 
 
 		 427 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  46.55 
 
 		 426 aa  322  8e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  37.23 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  29.78 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  31.21 
 
 		 521 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  28.08 
 
 		 478 aa  110  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  27.87 
 
 		 478 aa  108  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  26.67 
 
 		 503 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  27.11 
 
 		 546 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  26.95 
 
 		 546 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  26.95 
 
 		 546 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  25.31 
 
 		 513 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  29.55 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  25.6 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  28.89 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  28.89 
 
 		 521 aa  81.6  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  25.86 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  29.91 
 
 		 525 aa  70.1  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  24.4 
 
 		 577 aa  68.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  22.78 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  21.97 
 
 		 595 aa  66.2  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  22.42 
 
 		 533 aa  63.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  22.17 
 
 		 587 aa  62  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  23.14 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  26.84 
 
 		 544 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  28.45 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  23.17 
 
 		 697 aa  59.7  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  21.11 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  21.11 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  21.21 
 
 		 602 aa  57.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  29.76 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  22.1 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  23.81 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  21.11 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  21.11 
 
 		 588 aa  57  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  21.46 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  21.11 
 
 		 588 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  31.15 
 
 		 477 aa  53.9  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1026  terminase, ATPase subunit  20.84 
 
 		 590 aa  53.9  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  20.86 
 
 		 602 aa  52.8  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  21.27 
 
 		 593 aa  51.6  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  22.38 
 
 		 601 aa  51.2  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  21.43 
 
 		 594 aa  50.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  22.47 
 
 		 585 aa  49.7  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0773  putative bacteriophage terminase  20.47 
 
 		 598 aa  49.7  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  22.95 
 
 		 594 aa  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  31.58 
 
 		 260 aa  47.4  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  24.52 
 
 		 505 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2916  hypothetical protein  20.71 
 
 		 589 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  20.23 
 
 		 589 aa  44.3  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  20.47 
 
 		 590 aa  43.5  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>