14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1915 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  530  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  27.03 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  26.15 
 
 		 426 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  30.21 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  30.54 
 
 		 477 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  30.14 
 
 		 477 aa  52.8  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  26.14 
 
 		 505 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  29.45 
 
 		 476 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  29.45 
 
 		 476 aa  48.9  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  23.25 
 
 		 457 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  31.58 
 
 		 452 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  25.85 
 
 		 441 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  22.89 
 
 		 482 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  28.97 
 
 		 443 aa  42  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>