16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0456 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  855    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  32.67 
 
 
418 aa  219  8.999999999999998e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  31.37 
 
 
461 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3236  hypothetical protein  23.08 
 
 
428 aa  80.1  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00133637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2404  hypothetical protein  23.34 
 
 
436 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2794  hypothetical protein  22.28 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.128294 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  26.76 
 
 
421 aa  68.2  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3380  hypothetical protein  26.39 
 
 
433 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.835336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3419  hypothetical protein  25.93 
 
 
433 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  unclonable  1.80446e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  26.29 
 
 
423 aa  60.1  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0366334 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1915  hypothetical protein  30 
 
 
260 aa  56.2  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436221  hitchhiker  0.00000000650109 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  21.67 
 
 
534 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0801  hypothetical protein  23.81 
 
 
416 aa  50.4  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.887797  hitchhiker  0.00000709779 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  25.35 
 
 
505 aa  49.3  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1030  hypothetical protein  29.46 
 
 
402 aa  46.6  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0399083 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  22.12 
 
 
430 aa  43.1  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>