10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3419 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2794  hypothetical protein  79.17 
 
 		 433 aa  736    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.128294 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3380  hypothetical protein  98.61 
 
 		 433 aa  895    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.835336 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2404  hypothetical protein  72.13 
 
 		 436 aa  660    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3419  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  907    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.80446e-16 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3236  hypothetical protein  60.88 
 
 		 428 aa  538  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0801  hypothetical protein  51.77 
 
 		 416 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.887797  hitchhiker  0.00000709779 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  25.59 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1601  hypothetical protein  28.3 
 
 		 414 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000118956  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  25.93 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1896  hypothetical protein  22.54 
 
 		 443 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>