11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0801 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0801  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  868    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.887797  hitchhiker  0.00000709779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3380  hypothetical protein  51.77 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.835336 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3419  hypothetical protein  51.77 
 
 		 433 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  1.80446e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2794  hypothetical protein  51.3 
 
 		 433 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.128294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2404  hypothetical protein  51.4 
 
 		 436 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3236  hypothetical protein  51.7 
 
 		 428 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00133637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1601  hypothetical protein  29.22 
 
 		 414 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000118956  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  26.67 
 
 		 418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  23.81 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1089  threonyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 		 635 aa  46.2  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00500732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3918  hypothetical protein  24.88 
 
 		 439 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0145321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>