21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0577 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  100 
 
 		 430 aa  875    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1131  putative terminase B protein  92.56 
 
 		 430 aa  815    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.815847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0324  putative terminase B protein  92.56 
 
 		 430 aa  815    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0037  Ppx/GppA family phosphatase  50 
 
 		 433 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0853  hypothetical protein  29.96 
 
 		 499 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3756  PBSX family phage terminase large subunit  26.96 
 
 		 441 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  0.0951984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1746  putative phage terminase, large subunit  27.16 
 
 		 499 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628877  hitchhiker  0.00000000165176 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  27.37 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3879  hypothetical protein  26.54 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591729  normal  0.0947318 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1309  hypothetical protein  23.51 
 
 		 520 aa  62.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1030  hypothetical protein  35.48 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0399083 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2590  hypothetical protein  23.82 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  23.66 
 
 		 505 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  26.29 
 
 		 418 aa  56.2  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  26.71 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0366334 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0654  hypothetical protein  27.75 
 
 		 472 aa  55.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.485589  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2856  hypothetical protein  20.3 
 
 		 484 aa  53.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  20.75 
 
 		 461 aa  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0896  hypothetical protein  22.97 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1649  hypothetical protein  24.87 
 
 		 602 aa  44.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  22.12 
 
 		 414 aa  43.5  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>