19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1131 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0324  putative terminase B protein  100 
 
 
430 aa  879    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1131  putative terminase B protein  100 
 
 
430 aa  879    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.815847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  92.56 
 
 
430 aa  815    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0037  Ppx/GppA family phosphatase  50.46 
 
 
433 aa  414  1e-114  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0853  hypothetical protein  29.52 
 
 
499 aa  100  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1746  putative phage terminase, large subunit  27.98 
 
 
499 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628877  hitchhiker  0.00000000165176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3756  PBSX family phage terminase large subunit  28.04 
 
 
441 aa  89  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  0.0951984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  29.32 
 
 
421 aa  75.1  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1309  hypothetical protein  22.63 
 
 
520 aa  65.5  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  27.32 
 
 
418 aa  64.3  0.000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3879  hypothetical protein  26.05 
 
 
471 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591729  normal  0.0947318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1030  hypothetical protein  37.4 
 
 
402 aa  62.4  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0399083 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  24.43 
 
 
505 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0654  hypothetical protein  28.32 
 
 
472 aa  54.7  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.485589  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2590  hypothetical protein  26.78 
 
 
505 aa  54.7  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2856  hypothetical protein  19.94 
 
 
484 aa  53.5  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  21.03 
 
 
461 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  25.71 
 
 
423 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0366334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0896  hypothetical protein  22.5 
 
 
450 aa  43.9  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>