28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0719 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0719  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  940    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2354  hypothetical protein  32.79 
 
 		 490 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5696  PBSX family phage terminase large subunit  37.08 
 
 		 440 aa  152  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  37.25 
 
 		 504 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1463  Phage terminase, large subunit, PBSX  35.1 
 
 		 417 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.8452  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2189  hypothetical protein  34.65 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.580181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  28.25 
 
 		 523 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  27.17 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  33.19 
 
 		 539 aa  99.4  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0227  PBSX family phage terminase large subunit  29.71 
 
 		 402 aa  91.7  3e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5804  putative phage terminase large subunit  30.49 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  31.37 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  28.51 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3056  phage terminase, large subunit, PBSX family  29.46 
 
 		 421 aa  74.7  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345936  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0386  hypothetical protein  29.11 
 
 		 543 aa  70.5  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00110205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1942  PBSX family phage terminase large subunit  25.63 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16151  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2427  terminase large subunit  36 
 
 		 342 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1143  phage terminase, large subunit, PBSX family  24.37 
 
 		 424 aa  63.2  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2467  hypothetical protein  30.37 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.408666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1131  putative terminase B protein  21.03 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.815847  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0324  putative terminase B protein  21.03 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2551  hypothetical protein  30.73 
 
 		 497 aa  51.2  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  26.02 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  20.75 
 
 		 430 aa  50.1  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  24.88 
 
 		 505 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1030  hypothetical protein  27.41 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0399083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  27.65 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  26.24 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0366334 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>