19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2829 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2829  hypothetical protein  100 
 
 
534 aa  1113    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3729  hypothetical protein  49.16 
 
 
525 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1291  hypothetical protein  48.78 
 
 
525 aa  522  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0834175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0375  hypothetical protein  46.07 
 
 
526 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0776802  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2129  hypothetical protein  46.21 
 
 
527 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1310  hypothetical protein  44.8 
 
 
522 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0537638  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1245  hypothetical protein  45.08 
 
 
530 aa  451  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0027528  normal  0.060022 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4366  hypothetical protein  25.93 
 
 
496 aa  166  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.9507  normal  0.531855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3519  large subunit terminase  25.93 
 
 
568 aa  139  1e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.918493  hitchhiker  0.00317443 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  26.1 
 
 
477 aa  102  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  25 
 
 
477 aa  94.4  5e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2353  putative terminase large subunit protein  27.11 
 
 
527 aa  91.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.158978  unclonable  0.0000000253606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1699  putative terminase large subunit protein  27.25 
 
 
539 aa  85.1  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.140873  normal  0.0380156 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0726  putative terminase large subunit protein  26.75 
 
 
523 aa  76.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.964001  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1003  putative DNA packaging protein GP17 (terminase)  25.43 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0854  hypothetical protein  29.38 
 
 
229 aa  61.6  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2187  terminase large subunit  30.05 
 
 
194 aa  60.5  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.479041 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0456  hypothetical protein  21.67 
 
 
414 aa  52  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.756141  normal  0.686436 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  22.28 
 
 
421 aa  49.7  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>