65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2933 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  100 
 
 		 443 aa  914    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  67.29 
 
 		 457 aa  565  1e-160  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  63.72 
 
 		 441 aa  541  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  65.69 
 
 		 452 aa  538  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  63.21 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  63.21 
 
 		 476 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  48.1 
 
 		 427 aa  344  2e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  46.21 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  39.77 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  29.56 
 
 		 523 aa  157  4e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  34.32 
 
 		 521 aa  155  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  26.7 
 
 		 478 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  26.27 
 
 		 503 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  26.05 
 
 		 478 aa  105  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  26.25 
 
 		 546 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  25.84 
 
 		 525 aa  86.3  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  25.47 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  25.47 
 
 		 521 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  27.77 
 
 		 560 aa  80.5  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  29.15 
 
 		 519 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  30.22 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  24.95 
 
 		 546 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  24.54 
 
 		 546 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0943  hypothetical protein  25.41 
 
 		 697 aa  72  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  26.27 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0587  hypothetical protein  19.87 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.50668 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  25.71 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01363  phage terminase, ATPase subunit  22.68 
 
 		 533 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.35276  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0695  hypothetical protein  21.44 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  30.21 
 
 		 517 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1399  hypothetical protein  21.8 
 
 		 594 aa  60.8  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1384  hypothetical protein  32.57 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2327  hypothetical protein  20.93 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  21.33 
 
 		 594 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  23.11 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0704  hypothetical protein  20.79 
 
 		 682 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5052  hypothetical protein  20.79 
 
 		 682 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3493  hypothetical protein  21.35 
 
 		 591 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.68635e-25 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1282  hypothetical protein  22.96 
 
 		 602 aa  55.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37610  Phage P2 terminase ATPase subunit, gpP-like protein  21.69 
 
 		 585 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2937  hypothetical protein  21.35 
 
 		 591 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.83908e-26 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0564  hypothetical protein  31.61 
 
 		 477 aa  53.5  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  21.58 
 
 		 596 aa  52.4  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3171  hypothetical protein  20.77 
 
 		 589 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4323  phage large terminase subunit GpP  21.99 
 
 		 590 aa  51.6  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00512482 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0720  hypothetical protein  22.48 
 
 		 602 aa  51.6  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  22.46 
 
 		 595 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0897  hypothetical protein  19.29 
 
 		 595 aa  48.9  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.672051  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05025  hypothetical protein  21.21 
 
 		 593 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0207  hypothetical protein  20.8 
 
 		 583 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.256688 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1352  putative ATPase subunit of terminase (gpP-like)  30.83 
 
 		 601 aa  48.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.211848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3052  phage large terminase subunit GpP  21.23 
 
 		 590 aa  47.8  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.680947  hitchhiker  0.000000111956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  25.78 
 
 		 544 aa  47  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  22.48 
 
 		 493 aa  46.6  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2641  hypothetical protein  19.6 
 
 		 570 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1057  terminase  21.61 
 
 		 605 aa  46.2  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00841  hypothetical protein  22.6 
 
 		 588 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00833  Terminase, ATPase subunit  22.6 
 
 		 588 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2868  terminase, ATPase subunit  22.05 
 
 		 588 aa  44.7  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4364  hypothetical protein  19.43 
 
 		 589 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000106491 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3050  terminase, ATPase subunit  22.6 
 
 		 588 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00590407 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0924  terminase, ATPase subunit  22.6 
 
 		 588 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2777  hypothetical protein  22.6 
 
 		 588 aa  43.9  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000134113 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1356  hypothetical protein  27.2 
 
 		 254 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3501  hypothetical protein  20.35 
 
 		 589 aa  43.5  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>