30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1642 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  100 
 
 		 517 aa  1048    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  59.79 
 
 		 525 aa  566  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  56.22 
 
 		 544 aa  501  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  52.55 
 
 		 513 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  51.11 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  50 
 
 		 546 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  49.6 
 
 		 546 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  49.6 
 
 		 546 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  48.13 
 
 		 519 aa  425  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  48.45 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  48.45 
 
 		 521 aa  420  1e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  48.12 
 
 		 490 aa  394  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  47.22 
 
 		 493 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  45.05 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  37.12 
 
 		 595 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  27.79 
 
 		 427 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  27.16 
 
 		 426 aa  97.8  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  25.31 
 
 		 482 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  33.61 
 
 		 476 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  33.61 
 
 		 476 aa  87  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  27.85 
 
 		 521 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  28.45 
 
 		 452 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  30.53 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  29.71 
 
 		 441 aa  64.7  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0649  hypothetical protein  22.05 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  29 
 
 		 457 aa  59.3  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1222  hypothetical protein  27.62 
 
 		 534 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0800  hypothetical protein  26.29 
 
 		 445 aa  48.5  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1154  gp33 TerL  25.65 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.041853  hitchhiker  0.000000000115818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1828  hypothetical protein  25.93 
 
 		 531 aa  44.3  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0142111 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>