30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1282 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  100 
 
 		 493 aa  1003    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  59.04 
 
 		 490 aa  552  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  50.64 
 
 		 513 aa  452  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  46.01 
 
 		 544 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  46.31 
 
 		 546 aa  408  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  46.31 
 
 		 546 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  45.29 
 
 		 546 aa  404  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  45.02 
 
 		 519 aa  395  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  44.81 
 
 		 521 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  44.81 
 
 		 521 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  42.18 
 
 		 525 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  47.02 
 
 		 517 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  41.1 
 
 		 560 aa  339  5.9999999999999996e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  42.79 
 
 		 547 aa  332  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  36.45 
 
 		 595 aa  300  3e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  26.08 
 
 		 427 aa  104  4e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  26.86 
 
 		 426 aa  90.5  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  24.69 
 
 		 482 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  23.59 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  25.14 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  22.96 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  23.36 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  23.33 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  23.33 
 
 		 476 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  23.25 
 
 		 503 aa  53.5  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4503  hypothetical protein  25.07 
 
 		 457 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.443193 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0641  protein of unknown function DUF264  23.72 
 
 		 478 aa  50.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  23.16 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3289  hypothetical protein  27.52 
 
 		 596 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.699131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2800  putative conserved hypothetical protein  26.71 
 
 		 594 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>