26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3391 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3391  Mu-like prophage FluMu protein GP28  100 
 
 		 544 aa  1107    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.50016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1642  hypothetical protein  56.07 
 
 		 517 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3008  hypothetical protein  47.59 
 
 		 547 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.505507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1876  hypothetical protein  49.68 
 
 		 513 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0764  portal protein  49.58 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0673  portal protein  49.58 
 
 		 521 aa  442  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2135  prophage MuSo1, portal protein, putative  49.79 
 
 		 546 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2679  prophage MuSo2, portal protein, putative  48 
 
 		 519 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2088  prophage MuSo1, portal protein, putative  49.37 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0947183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0666  prophage MuSo1, portal protein, putative  49.16 
 
 		 546 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3782  hypothetical protein  46.19 
 
 		 525 aa  420  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.468452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1282  portal protein, putative  45.93 
 
 		 493 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.709860000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3372  portal protein, putative  44.62 
 
 		 490 aa  379  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2249  hypothetical protein  44.53 
 
 		 560 aa  361  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2701  Mu-like prophage FluMu protein gp28-like  40.08 
 
 		 595 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2103  hypothetical protein  29.67 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.136375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1297  hypothetical protein  29.67 
 
 		 476 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1969  hypothetical protein  26.83 
 
 		 426 aa  77  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.527917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3416  hypothetical protein  27.54 
 
 		 521 aa  75.9  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.940331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3048  hypothetical protein  26.84 
 
 		 452 aa  61.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0449427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3406  hypothetical protein  25.51 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.662335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1911  protein of unknown function DUF264  37.01 
 
 		 427 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.695816 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0670  protein of unknown function DUF264  29.92 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2933  prophage MuMc02, terminase, ATPase subunit, putative  25.78 
 
 		 443 aa  46.6  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0566615  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1017  protein of unknown function DUF264  23.11 
 
 		 478 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0830  protein of unknown function DUF264  23.15 
 
 		 503 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>